1. NG PAM配列を認識する改変型SpCas9による植物ゲノム編集
[出典] "Genome editing in plants by engineered CRISPR–Cas9 recognizing NG PAM" Endo M, Mikami M, Endo A, Kaya H, Itoh T, Nishimasu H, Nureki O, Toki S. Nat Plants. 2018-12-10.
  • 農研機構、横浜市大ならびに東大の研究チームはSpCas9-NGv1によるイネとシロイヌナズナへの効率的変異誘発を実現；SpCas9-NGv1のニッカーゼ版とシチジンデアミナーゼを組みあわせ、標的配列の５末端近傍での一塩基編集 (CをTへ置換)を実現
  • [PAM拡張crisp_bio関連記事]2018-08-31 SpCas9-NG：SpCas9の標的範囲をさらに広げる合理的な変異導入
2. PAMを拡張したxCas9によるイネゲノム編集
[出典] "xCas9 expands the scope of genome editing with reduced efficiency in rice" Wang J, Meng X, Hu X, Sun T, Li J, Wang K, Yu H. Plant Biotechnol J. 2018-12-13.
  • 哺乳類ゲノムにおいてGAT, GAA and NG PAMsを認識するSpCas9由来xCas9をイネのコドンに最適化した２種類 ( xCas9 3.6とxCas9 3.7)を評価し、SpCas9よりも広範なPAMsを認識するが編集効率は低いことを見出し、哺乳類ゲノム編集との温度と細胞内環境の差異の影響を示唆した。
  • [crisp_bio関連記事] 2018-03-02 xCas9：PAMの拡張とオフターゲット抑制を両立
3. CRISPR-Cpf1システムの藍藻類アナベナPCC 7120ゲノム編集への最適化
[出典] "Expanding the potential of CRISPR-Cpf1 based genome editing technology in the cyanobacterium Anabaena PCC 7120" Niu TC, Lin GM, Xie LR, Wang ZQ, Xing WY, Zhang JY, Zhang CC. ACS Synth Biol. 2018-12-10.
  • 二重スペーサ利用による編集効率向上 (100%)；異なる薬剤耐性マーカを備えたプラスミドによる多重編集；カウンターセレクション・マーカ利用による遺伝子編集繰り返し実験；条件付き活性化による必須遺伝子編集；118 kbに及ぶDNA断片削除
4. [展望]CRISPR-Casシステムに基づく次世代プロバイオティック・ラクトバチルス属
[出典] "Harnessing CRISPR-Cas systems for precision engineering of designer probiotic lactobacilli" Goh YJ, Barrangou R. Curr Opin Biotechnol. 2018-12-06.
  • プロバイオティック・ラクトバチルス属内在CRISPR-Casシステムの概観
  • 内在システム(タイプIとⅡ)ならびに異種CRISPR-Casシステム(タイプIIとV)の利用：プロバイオティックス微生物としてのストレス耐性と腸内環境適応性の向上；ワクチンや粘膜送達への利用；免疫調節など膜表面の機能化による疾患予防
5. [特許] 殺菌、遺伝子(群)のフェノタイプ同定、ゲノムサイズ縮小そしてまたは遺伝子欠失を目的とする CRISPR核酸に基づく微生物 (バクテリア、アーケア、藻類および酵母)の必須遺伝子と非必須遺伝子および非必須ゲノムアイランドのスクリーン
  • 特許登録日 (grant)  2018-11-27. 発明者 Barrangou R, Selle KM；権利者 North Carolina State University.
6. CRISPR-Casシステムがカンピロバクターの抗菌剤耐性を亢進する
[出典] "The CRISPR-cas system promotes antimicrobial resistance in Campylobacter jejuni" Shabbir MAB [..]  Hao H, Yuan Z. Future Medicine. 2018-12-11.
  • Cas9遺伝子欠損株と野生株の耐性能とトランスクリプトーム解析などからcas9遺伝子が、抗菌耐性を亢進する一連の遺伝子を調節することを同定
7. ToeholdリボスイッチをsgRNAに組み込むことで、E. coliにおいて内在RNAによるCRISPR-Cas9の活性調節を実現
[出典] "Riboregulated toehold-gated gRNA for programmable CRISPR–Cas9 function" Siu KH, Chen W. Nat Chem Biol. 2018-12-10. 
  • Toehold-gated gRNA (thgRNA) を考案し、E. coliにおいて多重転写調節を実現
8. [特許] mRNACRISPR-Cas sgRNAライブラリ構築法
[出典] "CRISPR-Cas sgRNA library"  US 2018/0340176
  • 公開日 2018-11-29. 発明者 Arakawa H. 権利者 IFOM Fondazione Istituto FIRC di Oncologia Molecolare.
  • [crisp_bio関連記事]CRISPR関連文献メモ_2016/08/28 - 1. mRNAからgRNAライブラリーを構築：あらゆる生物を対象として、また、バイオインフォマティクスで特定できないゲノム領域の編集も可能に
9. CRISPR-C: 二重微小染色体など環状 DNA/染色体形成モデル作出法
[出典] "CRISPR-C: circularization of genes and chromosome by CRISPR in human cells" Møller HD, Lin L, Xiang X [..] Luo Y. Nucleic Acids Res. 2018-12-14:46(22):e131. Online 2018-08-24.
  • 細胞質環状DNA (extrachromosomal circular DNA, eccDNA)と環状染色体が、遺伝疾患や癌の細胞に見られるが、U Copenhagen, Aarhus U, BGIなどのデンマーク・中・英・米の研究グループは今回、eccDNA研究基盤となるCRISPR技術によるeccDNA作出法を開発した。
  • [crisp_bio詳細記事] CRISPRメモ_2018/08/30 - 2. CRISPR-C: ヒト細胞においてCRISPR技術により遺伝子と染色体を環状化
10. 糖重合体を介した大きな (4.7~10 kbp)プラスミドのトランスフェクションと、 ヒト初代皮膚線維芽(HDF)細胞ならびにiPS細胞におけるCRISPR-CAS9転写活性とを顕著に亢進する分子添加物
[出典] "Molecular Additives Significantly Enhance Glycopolymer-Mediated Transfection of Large Plasmids and Functional CRISPR-Cas9 Transcription Activation Ex Vivo in Primary Human Fibroblasts and Induced Pluripotent Stem Cells" Boyle WS, Twaroski K, Woska EC, Tolar J, Reineke TM. Bioconjug Chem. 2018-12-10.
  • 大きなプラスミドをHDF細胞とiPS細胞へとトランスフェクション可能であるがHDF細胞からは殆ど除去されiPS細胞では激減する。U Minnesotaの研究チームは今回、トレハロースを含むカチオン性糖高分子(Tr4)をヘパリンで処理する (Tr4-heparin)送達法の効率を核膜を不安定化する分子を添加することで向上させることができることを見出した。
  • 実証実験として、Tr4-heparinにデキサメゾン (dexamethasone)を添加し、VII型コラーゲン遺伝子を標的とするdCas9-VP64を送達し、HDF細胞とiPS細胞におけるコラーゲン発現をそれぞれ5倍と20倍へと亢進しLipofectamine 2000による送達を超えた。
11. CRISPRa (dCas9-VPR)によりXPCとHR23B遺伝子の発現を共に亢進することで、 HEK293T細胞の耐放射線性向上を実現
[出典] "Increasing Cellular Radioresistance by Simultaneous CRISPR/dCas9-Driven Overexpression of XPC and HR23B Genes" Velegzhaninov I, Pylina Y, Rybak A, Shadrin D, Belykh E, Klokov D. Preprints. 2018-12-11.