[出典] W. Gu et al. “Depletion of Abundant Sequences by Hybridization (DASH): using Cas9 to remove unwanted high-abundance species in sequencing libraries and molecular counting applications.” Genome Biol. 2016 Mar 4;17:41 ; Corresponding author J. L. DeRisi (UCSF)
  • DASH (Depletion of Abundant Sequences by Hybridization) 法を開発。全ゲノムやメタゲノムのライブラリーにおいて解析対象以外の配列を排除し、結果的に対象配列をエンリッチメント
  • HeLa細胞:全RNAの61%が12Sと16SミトコンドリアrRNA。ミトコンドリアrRNAを標的とする54種類のsgRNAを組み込んだDASHによって、その99%以上をシーケンシングから排除し、結果的にその他のRNAのエンリッチメントを実現。
  • 感染症に因る髄膜炎と脳炎患者の脳脊髄液:メタゲノム解析において、DASHを利用するとヒトのミトコンドリア12Sと16S遺伝子が大きく減少し、病原菌由来の16Sまたは18Sのフラグメントが2〜3.9倍に。
  • ヒトがん細胞:KRAS G12を標的とするsgRNAを組み込んだDASHによって予め野生型KRAS排除(DAShing)し、変異型KRAS G12D(c.35G>A)の検出感度を大幅増。
  • [情報拠点注] 関連論文