[出典] "Satb1 integrates DNA binding site geometry and torsional stress to differentially target nucleosome-dense regions" Ghosh RP, Shi Q [..] Liphardt JT. Nat Commun 2019-07-19. bioRxiv 2018-10-26.
  • Stanford Universityを中心とする米国研究グループは今回、CRISPRノックインによるSatb1のeGFP標識とCRISPRノックアウトを介した内在Satb1の誘導型Satb1または短縮型Satb1への置換、生細胞イメージング (光退色後蛍光回復/FRAP法; 蛍光相関分光法; 一分子追跡法)、ゲノミクス (ChIP-seq; ATAC-seq; ChIP-ATAC-seq; TMP-seq)およびヌクレオソーム結合in vitroアッセイを組み合わせて、表題課題に取り組んだ。
  • Satb1はヌクレオソームが密な領域を優先的に標的し、DNAへの結合が、DNAの捻れ、隣接するDNAの形状、Satb1結合モチーフの密度と周期性の条件の組み合わせに依存することを明らかにした。