[出典] "[Confirmatory Results] Reply: Evidence that APP gene copy number changes reflect recombinant vector contamination" Lee et al. bioRxiv. 2019-08-13.
  • Kimら[*1]は、「脳に見られる体細胞組み換え (somatic gene recombination: SGR)とアミロイドβ前駆体タンパク質 (APP)のゲノムに相補的なDNAs (gencDNAs)は、プラスミドPCRのアーティファクトであり、自然発生したものではない」(bioRixv 2019-08-03)とした。
  • 我々 (Leeら)のNature論文[*3]は、先行論文の3種類の解析と、独自に行なった9種類の解析に基づいており、そのうち7種類は、APP PCRとは独立な解析であった。 Nature論文発表後に、プルダウン・データセットにおいてコンタミネーションを同定したが、そのコンタミネーションが結論に影響を及ぼさないことを、再解析で確認した。 特に、APPと細胞型によるAPP gnecDNAの数と型の変化を、プラスミドのコンタミネーションとPCRアーティファクトでは説明できなかった。
  • Kimらの3種類の解析 (プラスミドコンタミネーションの同定、プラスミドPCRおよび単一細胞シーケンシング)についても検証した。
gencDNAsをめぐる経緯
  1. 2019-08-03 bioRixv投稿、Nature掲載'APP gencDNSs'論文の問題点を指摘
  2.  [解説]アルツハイマー病に見られるAPP遺伝子組換えモザイク
  3. 2018-11-26 アルツハイマー病患者と健常者の神経細胞の双方に、体細胞組み換えに由来するAPP遺伝子変異を見た