[出典] "[Confirmatory Results] Reply: Evidence that APP gene copy number changes reflect recombinant vector contamination" Lee et al. bioRxiv. 2019-08-13.
- Kimら[*1]は、「脳に見られる体細胞組み換え (somatic gene recombination: SGR)とアミロイドβ前駆体タンパク質 (APP)のゲノムに相補的なDNAs (gencDNAs)は、プラスミドPCRのアーティファクトであり、自然発生したものではない」(bioRixv 2019-08-03)とした。
- 我々 (Leeら)のNature論文[*3]は、先行論文の3種類の解析と、独自に行なった9種類の解析に基づいており、そのうち7種類は、APP PCRとは独立な解析であった。 Nature論文発表後に、プルダウン・データセットにおいてコンタミネーションを同定したが、そのコンタミネーションが結論に影響を及ぼさないことを、再解析で確認した。 特に、APPと細胞型によるAPP gnecDNAの数と型の変化を、プラスミドのコンタミネーションとPCRアーティファクトでは説明できなかった。
- Kimらの3種類の解析 (プラスミドコンタミネーションの同定、プラスミドPCRおよび単一細胞シーケンシング)についても検証した。
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