2020年05月

[出典] "crispRdesignR: A Versatile Guide RNA Design Package in R for CRISPR/Cas9 Applications" Beeber D, Chain FJJ. J Genomics 2020-05-18; プログラム入手先 https://github.com/dylanbeeber/crispRdesignR UMASS Lowellの研究チームが、6-bp以内の任意のPAM配列 ... もっと読む

[出典] "Cas9 activates the p53 pathway and selects for p53-inactivating mutations" Enache OM, Rendo V [..] Ben-David U. Nat Genet 2020-05-18. 背景と概要今や機能ゲノミクスの有力なツールとなったCRISPR-Cas9 ノックアウト (KO)スクリーンとDNA損傷応答を担うp ... もっと読む

[出典] "Discovery of multiple anti-CRISPRs uncovers anti-defense gene clustering in mobile genetic elements" Pinilla-Redondo R, Shehreen S, Marino ND, Fagerlund RD, Brown CM, Sørensen SJ, Fineran PC, Bondy-Denomy J. bioRxiv 2020-05-22.  ファージを含むM ... もっと読む

[出典] "A natural single-guide RNA repurposes Cas9 to autoregulate CRISPR-Cas expression" Workman RE, Pammi T [..] Modell JW. bioRxiv 2020-05-21. 背景 [Figure S1引用下図参照] タイプII CRISPR-Casシステムは、侵入DNA断片をスペーサとして格納してきたCRISPRア ... もっと読む

[出典] "Massively parallel quantification of CRISPR editing in cells by TRAP-seq enables better design of Cas9, ABE, CBE gRNAs of high efficiency and accuracy" Xiang X, Qu K, Liang X, Pan X [..] Lin L, Luo Y. bioRxiv 2020-05-21. Aarhus UniversityとBGI-Qi ... もっと読む

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