[出典1] "A bacteriophage nucleus-like compartment shields DNA from CRISPR nucleases" Mendoza SD,  Nieweglowska ES [..] Bondy-Denomy J. Nature 2019-12-09.
[crisp_bio 注] UCSFの研究グループによるこのNature論文の内容については、bioRiv投稿版 [1]に準拠してCRISPRメモ_2018/07/19の[第5項]で紹介済み。Nature版とbioRxiv版ではアブストラクトのテキストをはじめとして図の構成も改訂されているが、表題の「戦略」の機構モデルについては変更が無いように見える。

[出典2] "A jumbo phage that forms a nucleus-like structure evades CRISPR–Cas DNA targeting but is vulnerable to type III RNA-based immunity" Malone LM [..] Fineran PC. Nat Microbiol. 2019-12-09. < "A nucleus-forming jumbophage evades CRISPR-Cas DNA targeting but is vulnerable to type III RNA-based immunity" Malone LM [..] Fineran PC. bioRxiv. 2019-09-25. 

 CRISPR-Casシステムはバクテリアにファージに抗する獲得免疫システムをもたらす。一方で、ファージは、ゲノムDNAの変異や修飾 [2]、抗-CRISPRタンパク質 (anti-CRISPR proteins: Acr)の生産などを介して、CRISPR-Casシステムを巧みに免れる。University of Otagoの研究グループは今回、Serratiaに感染するジャンボファージが、タイプI CRISPR-Casシステムを巧みに免れるが、タイプIII CRISPR-Casシステムには捕らえられることを見出した。

 2017年にPseudomonasのジャンボファージが感染した宿主細胞内で、タンパク質性のシェルで囲まれた核様構造 (以下、核)をとることが報告されたが [3-4]Serratia 菌のジャンボファージも同様に振る舞い、シェルを介して空間的にファージの核からSerratiaのタイプI-E、I-FおよびIII-A CRISPR-Casシステムを隔離し、ファージDNAをSerratia 菌の免疫応答から保護するに至る。

 タイプIII-Aシステムはしかし、侵入ssDNAの切断、DNAから転写されたRNAのcrRNA依存選択的切断およびセカンドメッセンジャーを介したウイルスRNAの非選択的分解の3種類の核酸切断活性を帯びており [5]、ファージのDNAではなく細胞質へと輸送されるファージRNAを標的とすることで、ジャンボファージの感染を阻害する。

[参考crisp_bio記事と文献]
  1. A nucleus-like compartment shields bacteriophage DNA from CRISPR-Cas and restriction nucleases. bioRxiv. 2019-07-17
  2. CRISPRメモ_2017/12/20 [第3項] バクテリオファージDNAの核酸塩基修飾に対抗する原核生物のCRISPR-Casシステム多様化
  3. Assembly of a nucleus-like structure during viral replication in bacteria. Chaikeeratisak V [..] Pogliano J. Science. 2017-01-13.
  4. The Phage Nucleus and Tubulin Spindle Are Conserved among Large Pseudomonas Phages. Chaikeeratisak V [..] Pogliano J. Cell Rep. 2017-08-15
  5. 2019-07-23 タイプIII-A CRISPRシステムにおけるRNAの非選択的切断の構造基盤
  6. Hiding from defence systems in a shell. Du Toit A. Nat Rev Microbiol. 2019-12-16