1. 半数体と二倍体のキメラ・アホロートルを作出し、肢再生の必須遺伝子を同定
[出典] Multiplex CRISPR/Cas screen in regenerating haploid limbs of chimeric Axolotls. Sanor LD, Flowers GP, Crews CM. eLife 2020-01-28. 
  • Yale Uの研究グループは今回、半数体と二倍体のキメラ型アホロートルを作出し (Figure 1引用下図参照)と、その半数体肢の再生におけるCRISPR/Cas機能喪失スクリーンから、catalaseとfetuin-bが、肢再生に必須であると同定Axolotls
2. 母系Cas9 (maCas9)を利用することで、効率が良く、モザイクが抑制され、9遺伝子座までの多重同時編集も可能な遺伝子改変マウス作出法を実現
[出典] Production of genetically engineered mice with higher efficiency, lower mosaicism, and multiplexing capability using maternally expressed Cas9. Sakurai T, Kamiyoshi A, Kawate H, Watanabe S, Sato M, Shindo T. Sci Rep 2020-01-23. 
  • 信州大学、鹿児島大学、農研機構の研究グループは今回、先行研究 [1]で開発したCas9トランスジェニックマウス (systemically Cas9-expressing transgenic, sCAT)内在Cas9 (maCas9)を利用する(maCas9-based genome editing)ゲノム編集法を応用して標題を実現、ただし、今回はｇRNAを先行研究のマイクロインジェクションに替えてエレクトロポレーション (Figure 3引用下図はノックインの例)。mice
 [参考crisp_bio記事]
  1. CRISPR関連文献メモ_2016/02/04 [第1項] Cas9を発現させたマウスにsgRNAを導入する多重遺伝子編集法：桜井敬之 (信州大学)
  2. CRISPRメモ_2018/11/01 [第5項]  [プロトコル]Cas9トランスジェニックマウス系統からゲノム編集が加えられた一肝細胞を同定し解析する
  3. CRISPRメモ_2019/07/17 [第2項] Bindel-PCR: CRISPR/Cas9を介した両アレルノックアウト細胞を同定する新手法を、Thermus aquaticus DNAポリメラーゼを利用するPCRを介して実現
3. [レビュー] CRISPRシステムによるゲノム編集から目的とする家畜品種を樹立するまでの技術とその応用
[出典] CRISPR in livestock: From editing to printing. Menchaca A, dos Santos-Neto PC, Mulet AP, Crispo M. Theriogenology. 2020-01-29. 

4. 既存薬剤の抗癌剤としての利用可能性 (drug repurposing)を測る
[出典] Discovering the anticancer potential of non-oncology drugs by systematic viability profiling. Corsello SM, Nagari RT [..] Golub TR. Nature Cancer 2020-01-20. 
  • PRISM法を開発したBroad研のTodd R. Golubをリーダとする研究グループは今回、Drug Repurposing Hub5から選択した抗癌剤とされてこなかった薬剤 (non-oncology compounds)3,466種類を含む4,518種類の薬剤の抗腫瘍性を、PRISM [1]法により、24種類の腫瘍型をカバーする578種類の癌細胞株で評価し、抗癌剤として有望な薬剤を同定し、ゲノムスケールのCRISPR-Cas9機能喪失 (CRISPR KO)スクリーンと機能獲得 (CRISPRa)スクリーンによる薬剤の標的遺伝子同定も行った。成果データはWebサイトからも公開されている [2]。
  1. High-throughput identification of genotype-specific cancer vulnerabilities in mixtures of barcoded tumor cell lines. Yu C [..] Golub TR. Nat Biotechnol. 2016 Apr;34(4):419-23. Online 2016-02-29 
  2. Webサイト: The PRISM drug repurposing resource 
5. 子宮頸癌にHPV18のE6とE7を同時に標的するCRISPR/Cas9システムをリポソームで送達
[出典] Gene targeting of HPV18 E6 and E7 synchronously by non-viral transfection of CRISPR/Cas9 system in cervical cancer. Ling K et al. Human Gene Therapy 2020-01-28. 
  • HeLa細胞とSiHa細胞および異種移植マウスモデルで、E6E7 KOの癌細胞の増殖抑制、E6とE7のmRNAとタンパク質発現の抑制、およびp53タンパク質発現亢進を同定した。
6. 原核生物ではNHEJによるゲノム編集の効率が低かったところ、NHEJの最適化を介してCas9-NHEJを介したマイコバクテリウム属のKO (二重変異、大規模変異を含む)を実現
[出典] A CRISPR-Assisted Nonhomologous End-Joining Strategy for Efficient Genome Editing in Mycobacterium tuberculosis. Yan MY, Li SS, Ding XY, Guo XP, Jin Q, Sun YC. mBio 2020-01-28.
  • MOH Key Laboratory of Systems Biology of Pathogens (北京)の研究グループがM. marinum、M. smegmatis、M. tuberculosis加えてE. coliにおいて、NHEJを介した変異誘導を検証
7. 病原遺伝子のCas9切断と2段階増幅によるE. coli O157:H7の高精度・高感度検出法
[出典] A CRISPR–Cas9 triggered two–step isothermal amplification method for E. coli O157:H7 detection based on metal–organic framework platform. Sun X [..] Gao Z. Anal Chem 2020-01-29. 
  • CRISPR-Cas9による病原遺伝子切断 -> SAD法で増幅 -> RCA法で増幅 -> 金属有機構造体上の消光状態の蛍光からの発光を測定；検出限界 4.0×101 CFU/mL
8. [スポットライト] Prime Editing: 新ゲノム編集術
[出典] [Spotlight] Prime Editing: A New Way for Genome Editing. Marzec M, Brąszewska-Zalewska A, Hensel G. Trends Cell Biol 2020-01-27. 

9. イネのCAO1遺伝子を対象として、SpCas9、LbCas12a (Cpf1)およびBEによる変異アレルシリーズ生成を比較
[出典] Beyond Seek and Destroy: how to Generate Allelic Series Using Genome Editing Tools. Herbert L, Meunier AC [..]  Périn C. Rice (N Y) 2020-01-28.
  • UMR-AGAPの研究グループの報告：SpCas9は、主として1塩基挿入と、多数の両アレル変異を誘導した。一方で、LbCas12aは主として短い欠失を誘導し、ヘテロ接合型変異が多数を占めた。また、Cas9に基づくBEによって効率~20%で終止コドン挿入を実現した。
10. 高性能であるが、MiSeqプラットフォームとYMAL形式のデータを必要とするGUIDE-seqを、誰でもが使えるようにするコンテナ化ソフトウエアGS-Preprocessを開発・公開
[出典] GS-Preprocess: Containerized GUIDE-seq Data Analysis Tools with Diverse Sequencer Compatibility. Rodríguez TC, Pratt HE [..] Zhu LJ. bioRxiv 2020-01-27.