1. Cas9の変異がDNAとヌクレアーゼ・ドメインのコンフォメーションに及ぼす影響を古典的全原子分子動力学シミュレーションにより分析
[出典] "Protein-Mutation-Induced Conformational Changes of the DNA and Nuclease Domain in CRISPR/Cas9 Systems by Molecular Dynamics Simulations" Ray A, Di Felice R. J Phys Chem B. 2020-02-21.
  • 著者らはCas9の野生型と3種類の変異型 (K855A, H982AおよびK855A+H982A) について、それぞれsgRNAと標的DNAとの三者複合体のシミュレーションを比較的長時間行った。
  • その結果、変異型では、sgRNAの直接の標的ではない方のDNA鎖 (非標的鎖)において、巻き戻される領域の柔軟性が亢進し、非標的鎖がCas9のHNH/RuvCから遠ざかろうとする一方で、野生型ではこの領域が静電相互作用においてRuvCドメインに安定して結合していることが、明らかになり、静電モデルの精密化に貢献することになった。
2. CRISPR-Cas9によるヒトのラミニンβ1のC末端を標識すると、分泌が阻害された
[出典] "CRISPR-Cas9-mediated labelling of the C-terminus of human laminin β1 leads to secretion inhibition" Shaw L, Williams RL, Hamill KJ. BMC Res Notes 2020-02-21
  • ラミニン (LM)は、細胞外マトリックスの基底膜を構成する巨大なタンパク質である。多細胞体制・組織構築とその維持、細胞接着、細胞移動、細胞増殖を促進し、がん細胞と関係が深い (ウイキペディアのラミニンの項から引用)。一方で、LMのターンオーバーやリモデリングの機構が、適切な分析ツールが無かったために、ほとんど解明されていなかった。
  • ヒトLMβ1の線虫ホモログについては、LMβ1鎖のC末端を光変換型蛍光タンパク質 (Dendra2)で標識した系が確立されたことから、著者らは、CRISPR−Cas9遺伝子編集技術により、A549ヒト肺胞基底上皮腺癌細胞株においてLMβ1のC末端標識を試みた。
  • その結果、細胞内では標識されたタンパク質の発現が見られたが、細胞外マトリックスではその発現が見られないこと、また、CRISPR-Cas9遺伝子編集を加えた細胞の増殖速度が低下することを、同定した。すなわち、ヒト細胞においては、LMβ1のC末端Dendra2標識はLMの分泌を阻害し、分析ツールには不適であることが示唆された。
3. 色素失調症: 46,XY染色体細胞からCRISPR/Cas9によりIKBKG欠失ヒトiPSCを樹立
[出典] "Incontinentia Pigmenti: Generation of an IKBKG deficient human iPSC line (KICRi002-A-1) on a 46,XY background using CRISPR/Cas9" Fatima A [..] Dhal N. Stem Cell Res 2020-02-20
  • 色素失調症は、IKBKG遺伝子の機能喪失変異による発症するX染色体優性外胚葉形成不全疾患である。表題により、発症の機構解明と薬剤スクリーニングに有用な色素失調症モデルとなるiPSCを樹立した。
4. [レビュー] CRISPR/Cas9遺伝子編集システムによる低免疫原性のコムギ品種の開発の現況と成果
[出典] "Status and contribution of CRISPR/Cas9 based gene-editing system in the development of a low-immunogenic wheat variety" Verma AK et al. Preprints 2020-02-21.
  • コムギは、セリアック病 (celiac disease)を引き起こすグルテンを含んでおり、グルテン含量が低いあるいはグルテンを含まない品種が求められている。著者らは、関連するオリジナルの研究論文をレビューし6倍体ゲノムを帯びたコムギにおいて、CRISPR/Cas9による免疫原性をもたらす遺伝子の削除および好ましい遺伝子への置換が可能であるが、セリアック病の治療に応用するには、さらなる研究開発が必要であると指摘した。
5. [書籍] CRISPR-Cas9システムによるゲノム工学
[書誌事項] "Genome Engineering via CRISPR-Cas9 System" Academic Press 2020-02-21
Editors: Vijai Singh,  Pawan Dhar
Chapter 1 - An introduction to genome editing CRISPR-Cas systems. Vijai Singh
Chapter 2 - Evolution and molecular mechanism of CRISPR/Cas9 systems. Kul Bhushan
Chapter 3 - Exploring the potential of CRISPR-Cas9 for the removal of human viruses. Happy Panchasara, Shreya Patel and Vijai Singh
Chapter 4 - Programmable removal of bacterial pathogens using CRISPR-Cas9 system. Gargi Bhattacharjee, Khushal Khambhati, ... Vijai Singh
Chapter 5 - Targeted genome editing using CRISPR/Cas9 system in fungi. Takayuki Arazoe and Osamu Mizutani
Chapter 6 - CRISPR-Cas9 system for fungi genome engineering toward industrial applications. Lakkakula Satish, Sasanala Shamili, ... Yaron Sitrit
Chapter 7 - Development and challenges of using CRISPR-Cas9 system in mammalians. Khushal Khambhati, Nisarg Gohil, ... Vijai Singh
Chapter 8 - CRISPR-Cas9 system “a mighty player in cancer therapy" Siddharth Manvati and Pawan K. Dhar
Chapter 9 - CRISPR-Cas9 for therapy: the challenges and ways to overcome them. Sundaram Acharya, Souvik Maiti and Debojyoti Chakraborty
Chapter 10 - Engineering of Cas9 for improved functionality. Dhvani Sandip Vora, Jaspreet Kaur Dhanjal and Durai Sundar
Chapter 11 - The current progress of CRISPR/Cas9 development in plants. Purva Bhalothia, Kalpesh Yajnik, ... Santosh Kumar Upadhyay
Chapter 12 - Fruit crops improvement using CRISPR/Cas9 system. Siddharth Tiwari, Navneet Kaur and Praveen Awasthi
Chapter 13 - CRISPR/Cas9 engineered viral immunity in plants. Dharmendra Pratap and Ankit Kumar
Chapter 14 - Genome engineering in medicinally important plants using CRISPR/Cas9 tool.  Anshu Alok, Prateek Jain, ... Purva Bhalothia
Chapter 15 - Genome editing of algal species by CRISPR Cas9 for biofuels. Amita Tanwar and Shashi Kumar
Chapter 16 - Development and use of CRISPR in industrial applications. Ali Samy Abdelaal and Syed Shams Yazdani
Chapter 17 - Functional understanding of CRISPR interference: its advantages and limitations for gene silencing in bacteria. Ajitesh Lunge, Eira Choudhary, ... Nisheeth Agarwal
Chapter 18 - Genome engineering in insects: focus on the CRISPR/Cas9 system. V. Edwin Hillary, Stanislaus Antony Ceasar and S. Ignacimuthu
Chapter 19 - Recent progress of CRISPR-Cas9 in zebra fish. Dharmendra Kumar Chaudhary, Sandeep Kumar Singh, ... Gargi Chapter 20 - CRISPR: a revolutionary tool for genome engineering in the protozoan parasites. Manish Sharma and Abhisheka Bansal
Chapter 21 - Emergent challenges for CRISPR: biosafety, biosecurity, patenting, and regulatory issues. Darren Braddick and Rina Fanny Ramarohetra.