[出典] "crisprSQL: a novel database platform for CRISPR/Cas off-target cleavage assays" Störtz F, Minary P. (U Oxford). Nucleic Acids Res. 2020-10-21.
- crisprSQL (version 10 July 2020)の概要 [Figure 1引用右図参照]
- 154のガイドRNAと25,632の標的配列を登録し、4,947本の標的配列はエピゲノムマーカ(DNase, CTCF, H3K4me3, RRBS, およびDRIP)のデータを伴っている。
- 対象ゲノムのアッセンブリーは、ヒト (HEK293, K562, HeLa, U2OS, HAP1) のhg19とhg38, マウス mm10とmm9m, およびラットのrn5
- データ源のリスト Table 1 参照 https://academic.oup.com/view-large/209177790
- crisprSQL Webサイトhttp://www.crisprsql.com [右図はWebサイトの画面キャプチャ]
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