[出典] "crisprSQL: a novel database platform for CRISPR/Cas off-target cleavage assays" Störtz F, Minary P.  (U Oxford). Nucleic Acids Res. 2020-10-212020-10-29 9.07.18
  • crisprSQL (version 10 July 2020)の概要 [Figure 1引用右図参照]
  • 154のガイドRNAと25,632の標的配列を登録し、4,947本の標的配列はエピゲノムマーカ(DNase, CTCF, H3K4me3, RRBS, およびDRIP)のデータを伴っている。
  • スクリーンショット 2023-07-16 10.31.54対象ゲノムのアッセンブリーは、ヒト (HEK293, K562, HeLa, U2OS, HAP1) のhg19とhg38, マウス mm10とmm9m, およびラットのrn5
  • データ源のリスト Table 1 参照 https://academic.oup.com/view-large/209177790
  • crisprSQL Webサイトhttp://www.crisprsql.com [右図はWebサイトの画面キャプチャ]