1.[レビュー] CRISPR/Cas9による逆遺伝学スクリーニング設計ガイダンスと将来展望

  • 【出典】“[REVIEW]Key elements for designing and performing a CRISPR/Cas9-based genetic screen.” Shanga, W, Wanga F, Fana G, Wanga H. J Genet Genomics. 22 Sep 2017.[ブログcrisp_bio] Crisp_bioからのアクセスは書誌事項とアブストラクト限定
2.CRISPR/Cas9のレンチウイルスデリバリーによるマウス網膜色素上皮細胞in vivoでのVegfa遺伝子ノックアウト

  • 【出典】“In vivo knockout of the Vegfa gene by lentiviral delivery of CRISPR/Cas9 in mouse
  • retinal pigment epithelium cells.”  Holmgaard A, ~ Corydon TJ.  Mol Ther Nucleic Acids. Available online 21 September 2017.
  • 設計した3種類のsgRNAsは、in vitroindel生成率4493%を達成。
  • マウス網膜下に注入して5週間後分離した網膜色素上皮細胞において、84%におよぶindels生成率と共に、血管内皮成長因子VEGFAの低減を確認。Indelsプロファイルは4-bpの欠失から2-bp挿入まで。

3.ラムダファージのノンカノニカル・サイト(2次的サイト)への挿入とその表現型への影響を解析

  • 【出典】“Combining Comprehensive Analysis of Off-Site Lambda Phage Integration with a CRISPR-Based Means of Characterizing Downstream Physiology.” Tanouchi Y, Covert MW. mBio. 2017 Sep 19;8(5). pii: e01038-17.
  • バクテリオファージは宿主染色体にそのDNAを組み込む事で溶原作用を介してバクテリア進化に関与する。ファージは通常、宿主染色体の特定のサイト(カノニカルサイト)に入り込むが、二次的サイトに入り込むことも知られている。今回、次世代シーケンシングに基づいた実験プロトコールを開発し、E. coliにおいて300ヶ所のファージ組み換えの二次的サイトを同定した。
  • 続いて、挿入図に示すCRISPR/Cas9スクリーニングにより、ファージの二次的サイトへの挿入が、細胞運動性や抗生物質耐性亢進などの表現型に与える効果を同定した。lysogens

4.CRISPR/Cas9を介したSNAP-tagによる生細胞中の細胞骨格可視化

  • 【出典】“Two-color 810 nm STED Nanoscopy of Living Cells with Endogenous SNAP-tagged Fusion Proteins.” Butkevich AN, Ta H, Ratz M, Stold S, Jakobs S, Belov VN, Hell SW. ACS Chem Biol. 2017 Sep 21.
  • 810nm STEDナノスコピーとシリコンローダミン680SiRとカーボピロニン610CPの二色蛍光色素利用による近赤外生細胞の超解像度イメージング。CRISPR/Cas9により、ビメンチンにSNAP-tagを付し、チューブリンに非共有結合ラベルを付すことで実現。

5.CRISPR/Cas9BLOS2をノックアウトすると、鱗翅目の農業害虫ハスモンヨトウ(Spodoptera litura)幼虫外皮のイエローストリップとホワイトが消失する

  • 【出典】“CRISPR/Cas9 mediated BLOS2 knockout resulting in disappearance of yellow strips and white spots on the larval integument in Spodoptera litura.” Zhu GH, Peng YC, Zheng MY, Zhang XQ, Sun JB, Huang Y, Dong SL. J Insect Physiol. 2017 Sep 16. pii: S0022-1910(17)30235-4.
  • S. lituraのトランスクリプトームデータベースから同定したリソソーム関連オルガネラ生合成複合体の一種SlitBLOS2の断片を標的とするCRISPR/Cas9により、モザイク状の半透明外皮を帯びたG0世代を得、G1世代でタイトルにある変異外皮を帯びたホモ型変異個体を得た。SlitBLOS2は鱗翅類の遺伝子機能解析および害虫制御に有用なマーカー遺伝子である。