1.CRISPR/Cas9により染色体を削減する
- [出典] "CRISPR/Cas9-mediated targeted chromosome elimination" Zuo E, ~ Hu J, Yang H. Genome Biol. 2017 Nov 24;18(1):224.
- 2017年11月28日 ブログ記事「CRISPR/Cas9により染色体を削減する」参照
2.CRISPRを巡る原核微生物とウイルスの共進化確率モデルから両者が共存する条件を同定
- [出典] "A Non-Classical Phase Diagram for Virus-Bacterial Co-Evolution Mediated by CRISPR" Han P, Deem MW. bioRxiv. Posted November 25, 2017.
3.[プロトコル]タンパク質の転写と安定性を制御するためのバクテリアゲノム編集戦略
- [出典] "Bacterial Genome Editing Strategy for Control of Transcription and Protein Stability" Lauritsen I, Martínez V, Ronda C, Nielsen AT, Nørholm MHH. Synthetic Metabolic Pathways, Methods Mol Biol. 2018;1671:27-37.
- 大腸菌において、任意の可溶性タンパク質の転写調節と分解誘導を可能とする遺伝子標識技術;CRISPRiとN末端則経路(N-end rule pathway)タンパク質分解に基づく;CRMAGE(CRISPR Optimized MAGE(Multiplex Automated Genome Engineering: YouTube) Recombineering);MAGE)によるゲノム編集;転写開始領域のランダム化によるタグ挿入に対する極性の影響最小化
- [出典] "CRISPR-Cas9 Toolkit for Actinomycete Genome Editing" Tong Y, Robertsen HL, Blin K, Weber T, Lee SY. Synthetic Metabolic Pathways, Methods Mol Biol. 2018;1671:163-184. First online 24 Nov 2017.
- スペーサー(sgRNA)同定ソフト、ランダム削除ライブラリー構築および遺伝子ノックダウン;USER(uracil-specific excision reagent)技術によりCIRSRベクター構築を単純化;S. coelicolor A3(2) とS. collinus Tü 365のゲノム編集で実証
5.[プロトコル]CasEMBLRにより酵母の代謝経路を改変
- [出典]"Assembly and Multiplex Genome Integration of Metabolic Pathways in Yeast Using CasEMBLR(*)" Jakočiūnas T, Jensen ED, Jensen MK, Keasling JD. Synthetic Metabolic Pathways, Methods Mol Biol. 2018;1671:185-201. Published online 24 Nov 2017.
- ゲノム上の複数サイトに発現カセット群を同時に挿入可能;[実証実験]3箇所の遺伝子座に15種類の外来DNA断片15種類を挿入することで酵母にカロテノイドの生合成経路を構築;2箇所の遺伝子座にDNA断片10種類を挿入しチロシン産生菌を作出
- (*) "CasEMBLR: Cas9-Facilitated Multiloci Genomic Integration of in Vivo Assembled DNA Parts in Saccharomyces cerevisiae" Jakočiu̅nas T, ~ Jensen MK, Keasling JD. ACS Synth Biol. 2015 Nov 20;4(11):1226-34. Web Publication March 17, 2015.
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