[出典]"LinkedOmics: analyzing multi-omics data within and across 32 cancer types" Vasaikar SV, Straub P, Wang J, Zhang B. Nucleic Acids Res. 2017 Nov 9. LinkedOmicsデータベースは、The Cancer Genome Atlas (TCGA)プロジェクト由来の患者のべ11,158人、32種類の ...
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タグ:データベース
がん患者のゲノムデータへのオープンアクセスを認める試み
(創薬等PF・構造生命科学ニュースウオッチ 2016/03/02) [出典]Becnel, L. B. et al. "An open access pilot freely sharing cancer genomic data from participants in Texas." Sci. Data. 2016 Feb 16;3:160010. Lauren B. BecnelらBaylor College of Me ...
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大腸癌のプロテオゲノミクス – 遺伝子変異とタンパク質発現量を繋ぐ
[出典] “Genomic Determinants of Protein Abundance Variation in Colorectal Cancer Cells.” Roumeliotis TI et al. Cell Rep 2017 Aug 29;20(9):2201–2214. bioRxiv. Posted December 9, 2016. 概要 ゲノム変異がタンパク質ネットワークに、ひいては細胞生 ...
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17種の癌/7,932人のデータから病理アトラス構築・公開 - 個別化医療の情報基盤へ
[出典] Uhlen M et al. “A pathology atlas of the human cancer transcriptome.” Science, 2017Aug 18;357(6352):eaan2507. Human Protein Atlas (HPA)プログラムの一環として、遺伝子・タンパク質のTissue Atlas(Science 2015)とCell Atlas(Science 2017) ...
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GenomeSpace:20種類のソフトウエアパッケージとデータソースをプログラミング不要で利用可能にするゲノム解析クラウド
(創薬等PF・構造生命科学ニュースウオッチ 2016/01/24)Cytoscape、Galaxy、GenePattern、Genomica、Integrative Genomic Viewer (IGV)、ならびにUCSC Table Browserの開発チームのコンソーシウム共同開発.参画機関は、UCSD、Broad Institute、Stanford Univers ...
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