タグ:機械学習-AI

[出典] "Determinants of Base Editing Outcomes from Target Library Analysis and Machine Learning" Arbab M [..] Liu DR. Cell 2020-06-12.  標的塩基のトランジッション変異を誘導する塩基エディター (CBEsとABEs)は、短期間で、病因SNV変異の修復を始めとして基礎と ... もっと読む

[出典] "Prediction of the sequence-specific cleavage activity of Cas9 variants" Kim N, Kim HK [..] Kim HH. Nat Biotechnol 2020-06-08.  CRISPR-SpCas9によるゲノム編集の精度向上やPAM改変を介した柔軟な編集の実現を目指して、SpCas9の改変体が作りだされてきたが ... もっと読む

1. CRISPRpred(SEQ): 一次配列データに基づき古典的機械学習によりsgRNAのオンターゲット活性予測器を開発し、深層学習モデルを凌ぐ性能を得た #機械学習-AI [出典] "CRISPRpred(SEQ): a sequence-based method for sgRNA on target activity prediction using traditional ... もっと読む

2020-06-04 第2項にてin pressとした引用したNature Communication論文の書誌事項とリンクを追加2020-05-31 初稿1. PaCRISPR: anti-CRISPRタンパク質 (Acr)を予測し可視化するWebサービス[出典] "PaCRISPR: a server for predicting and visualizing anti-CRISPR proteins" W ... もっと読む

[出典] "crispRdesignR: A Versatile Guide RNA Design Package in R for CRISPR/Cas9 Applications" Beeber D, Chain FJJ. J Genomics 2020-05-18; プログラム入手先 https://github.com/dylanbeeber/crispRdesignR UMASS Lowellの研究チームが、6-bp以内の任意のPAM配列 ... もっと読む

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