Corresponding author: 大嶋孝志 (九州大学)著者らが開発したμ-オキソ亜鉛四核クラスターはほぼ中性の条件下で極めて高い効率を示す環境調和型の触媒であり、求核性が本来高いアミノ基の存在下で求核性に劣る水酸基を選択的にアシル化するという特徴を有する：オキサゾリ …
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｜最終更新2019年 PDIS事業成果 , 最終更新2022年PDISニュースウオッチ・アーカイブ
水和構造の変化がマルチドメイン・タンパク質のコンフォメーション変化を可能にする
（創薬等PF・構造生命科学ニュースウオッチ 2016/06/08）Corresponding author: 中迫雅由（慶應義塾大学）低温X線結晶構造解析などから、タンパク質を水和する水分子がタンパク質が機能するために必要とする実験結果が得られていた。今回、ドメイン間の水分子がドメインの運 …
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｜CRISPR , 最終更新2022年PDISニュースウオッチ・アーカイブ
CRISPR-Cas9技術を使って転写の光スイッチを実現
（創薬等PF・構造生命科学ニュースウオッチ 2015/01/28）東京大学佐藤守俊研究室は、光によって複数の遺伝子の転写をオン・オフする手法“CRISPR-Cas9-based photoactivatable transcription system (以下、CPTS)”を確立した。【CPTSの概要】プローブとして２種類の融合タン …
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｜CRISPR , 最終更新2022年PDISニュースウオッチ・アーカイブ
CRISPR-Cas9システムの改変によって、ゲノムワイドでの転写を高効率で活性化するSAM法を開発
（創薬等PF・構造生命科学ニュースウオッチ 2015/01/30）CRISPR-Cas9技術の第一人者の１人Feng Zhang(Broad Institute)を始めとする米日の研究チームが、CRISPR-Cas9複合体に３種類の転写活性化ドメインを融合することによって、ゲノムワイドで、遺伝子ならびに長鎖ノンコー …
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｜CRISPR , 最終更新2022年PDISニュースウオッチ・アーカイブ
３研究グループがヒト細胞に不可欠な遺伝子群を同定
（創薬等PF・構造生命科学ニュースウオッチ 2015/11/28）（CRISPR関連文献メモ_2015/11/28）Science 誌11月27日号のPerspective"The indispensable genome”には、酵母の機能ゲノミクスを精力的に進めているCharles BooneとBrenda J. Andrewsによって、EUを中心とする研究グ …
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｜CRISPR , 最終更新2022年PDISニュースウオッチ・アーカイブ
CRISPR関連文献メモ_2016/06/07（２件）
（創薬等PF・構造生命科学ニュースウオッチ 2016/06/07）[ミニレビュー] CRISPR/Cas9によるゲノムワイドのプール型スクリーニングCorresponding author: Neville E. Sanjana (New York Genome Center/NYU)プール型の遺伝子スクリーニングが、プログラム可能なCRISPR/Cas9の …
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流行地域を始めとするフィールドでの利用が可能なジカ（Zika）ウイルス判定法の開発
（創薬等PF・構造生命科学ニュースウオッチ 2016/06/07）Corresponding author: James J. Collins (MIT; Wyss Inst.; Broad Inst.)J. J. Collinsの研究チームはこれまでに開発してきた以下の２種類の技術とNASBA (nucleic acid sequence-based amplification)と呼ばれる等 …
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膵臓がん早期発見につながる血中バイオマーカの測定を可能に
（創薬等PF・構造生命科学ニュースウオッチ 2016/06/06）Corresponding author: 大塚基之（東京大学）膵管がん（Pdac）は、早期発見が極めて困難であるため、発見時には治療困難な状態にまで進行していることが極めて多い。そこで、早期発見に有望なバイオマーカーが同定さ …
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KRas変異がんを合成致死へと誘導する化合物をスクリーニング
（創薬等PF・構造生命科学ニュースウオッチ 2016/06/06）Corresponding authors: Xiufeng Pang (華東師範大学); Mingyao Liu (華東師範大学/Texas A&M U. Health Science Center)ヒトがん全体の21%にKras の癌原性の体細胞変異が存在し、特に、膵臓、大腸および肺で高頻 …
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CRISPR関連文献メモ_2016/06/05（３件）
（創薬等PF・構造生命科学ニュースウオッチ 2016/06/05）[論文] クラス2タイプVI-A CRISPR/CasエフェクターC2c2の標的は一本鎖RNAであるOmar O. Abudayyeh et al. “C2c2 is a single-component programmable RNA-guided RNA-targeting CRISPR effector.” Science. Publ …
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TCRsのリン酸化は、抗原結合と膜貫通部位結合コレステロールの相互アロステリック調節を受ける
（創薬等PF・構造生命科学ニュースウオッチ 2016/06/05）Corresponding author: Wolfgang W.A. Schamel (Albert-Ludwigs-University of Freiburg)TCRs（T細胞受容体）と抗原の結合によってTCRsの細胞質内C末端に結合しているCD3分子がリン酸化され、T細胞の獲得免疫応答が …
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[PDIS]アラート：8重変異によるアデノシンA2a受容体の顕著な熱安定化を統計熱力学で解析
（創薬等PF・構造生命科学ニュースウオッチ 2016/06/05）Corresponding authors: 村田武士（千葉大学）；木下正弘（京都大学）GPCRの一種であるアデノシンA2a受容体（A2aR）の８重変異体が、極めて高い耐熱性を得る物理的要因を、2016年4月にJ. Phys. Chem. B. 誌に発表し …
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[PDIS]アラート：回収再利用可能な不均一系亜鉛/イミダゾール触媒によるエステル交換反応
（創薬等PF・構造生命科学ニュースウオッチ 2016/06/05）Corresponding author: 大嶋孝志（九州大学）広範な反応溶媒（トルエン、酢酸エチル、メタノール、および炭酸ジメチル）おいて優れた触媒活性を示し、活性を失うことなく回収再利用を５回繰り返すことが可能な不均一 …
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乳がん/子宮がん誘導を回避しつつ血管修復/代謝改善作用を示すエストロゲンを設計
（創薬等PF・構造生命科学ニュースウオッチ 2016/06/04）Corresponding author: Benita S. Katzenellenbogen (U. Illinois at Urbana-Champaign)エストロゲンの二面性傷害を受けた血管の修復や肝臓や脂肪組織における代謝を改善する作用を有する一方で、乳腺と子宮における …
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CRISPR関連文献メモ_2016/06/04（４件）
（創薬等PF・構造生命科学ニュースウオッチ 2016/06/04）[論文] CRISPRによる生細胞中での遺伝子座のラベル付けをRNAアプタマーを利用して２色化 Corresponding author: Siyuan Wang (Harvard University)これまでの多色ラベル化は異なる微生物種由来の不活性化Cas9（dCas …
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[展望] ヒトゲノムを「読む」から「書く」へ
（創薬等PF・構造生命科学ニュースウオッチ 2016/06/03）“秘密会合”からのレポートがScience から発表された：タイトルは“The Genome Project-Write”； 著者はJef D. Boeke (corresponding author), George Church, Andrew Hessel, Nancy J. Kelleyら25名“HGM-read …
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将来の薬剤耐性変異を織り込んだ第３世代mTOR阻害剤
（創薬等PF・構造生命科学ニュースウオッチ 2016/06/03）Corresponding authors: Neal Rosen (Memorial Sloan-Kettering Cancer Center); Kevan M. Shokat (UCSF)精密医療がもたらす選択圧によって腫瘍細胞の中の薬剤耐性サブポプレーションが増殖する。この腫瘍細胞の進 …
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単一ナイーブT細胞TCRの抗原親和性と配列を共に決定し、TCRレパトアの年齢依存を裏付け
（創薬等PF・構造生命科学ニュースウオッチ 2016/06/03）Corresponding author: Ning Jiang (University of Texas at Austin)新たなアッセイ法iTAST（in situ TCR affinity and sequence test)を開発MHC分子とペプチド断片の複合体（以下、pMHC）の多量体であり、極めて微 …
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[PDIS]アラート：細胞ベーススクリーニングによって、Gタンパク質共役型内向き整流性カリウムチャネル阻害剤としてプロフラビンを同定
Corresponding authors: 稲野辺 厚；倉智嘉久（大阪大学）Gタンパク質共役型内向き整流性カリウムチャネル（G Protein-Gated Inward Rectifier Potassium Channels, GIRKs）のサブユニットKir3.2の過剰発現が、ダウン症（DS）のある種の表現型に関与することが示唆されてい …
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[PDIS]アラート：結晶のサイズとX線の波長がS-SAD法による結晶構造解析に与える影響
Corresponding author: 千田俊哉（高エネルギー加速器研究機構）S-SAD法には、結晶に重原子を導入することなく内在の硫黄を利用する大きなメリットがある。しかし、硫黄の吸収端が低エネルギー領域にあるため（2.472 keV = 5.016 Å）、より短い波長に最適化されているほと …
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CRISPR関連文献メモ_2016/06/02（７件）
（創薬等PF・構造生命科学ニュースウオッチ 2016/06/02）[論文] Pro-SRSA法：CRISPR/Cas9による機能欠失型スクリーニングを組込んだタンパク質の細胞内安定性測定法Corresponding author: Tiebang Kang (中山大學 Cancer Center)Pro-SRSA（protein stability regulators sc …
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[PDIS]ご報告：創薬等PF・構造生命科学ニュースウオッチ２周年
2014年６月：創薬等PF・構造生命科学ニュースウオッチ記事掲載開始2014年６月の月間統計：掲載記事数 45件；一意な接続IP数 156件；訪問件数 284件2014年11月 Google Scholarのアラートを利用したPDIS成果論文の紹介掲載を開始 （これまでの[PDIS]記事のべ298件；複 …
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sgRNAの最適設計：CRISPR/Cas9の活性を最大限にオフターゲット編集を最小限に
（創薬等PF・構造生命科学ニュースウオッチ 2016/06/01）CRISPR関連文献メモ_2016/06/01（１件）Corresponding authors: John G. Doench; David E. Root (Broad Institute) / Nicolo Fusi; Jennifer Listgarten (Microsoft Research New England)Doenchらは、実験検証 …
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医薬・生物学ビッグデータから副作用の低減と機序について仮説を構築し実験検証
（創薬等PF・構造生命科学ニュースウオッチ 2016/06/01）Corresponding author: 金子周司（京都大学）非定型統合失調症治療薬（Atypical antipsychotics: 以下、AA）が引き起こす糖尿病による死亡に至る可能性もある高血糖の発生機序を明らかにし予防法を発見した。はじめに …
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Ly6C^{hi}単球は、腸内菌叢と海馬の神経新生を連関するメッセンジャーである
（創薬等PF・構造生命科学ニュースウオッチ 2016/06/01）Corresponding author: Susanne A. Wolf (Max-Delbrueck-Center for Molecular Medicine)成体マウスにおいて、抗生物質を７週間投与して腸内菌叢を徹底的に除菌すると、記憶能力が衰え、海馬における神経新生が欠損 …
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GESTALT法：合成DNAのゲノム編集パターンをバーコードとして、細胞系譜を追跡する
（創薬等PF・構造生命科学ニュースウオッチ 2016/05/31）CRISPR関連文献メモ_2016/05/31（１件）Corresponding authors: Alexander F. Schier (Harvard U/Broad); Jay Shendure (U. Washington, Seattle)色素、レポーター遺伝子などのマーカあるいは細胞分裂などを利用す …
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ニーマンピック病C型関連タンパク質NPC1のクライオ電顕解析から見えて来たコレステロール輸送とエボラ感染の機構
（創薬等PF・構造生命科学ニュースウオッチ 2016/05/31）Corresponding authors: Qiang Zhou; Nieng Yan (清華大学)ライソゾーム病の一種であるニーマンピック病C型は、NPC1 遺伝子またはNPC2 遺伝子の変異によって引き起こされる。それらの遺伝子産物であるタンパク質 …
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クライオ電顕、分子量100 kDaと分解能2 Åの壁を超えて、創薬支援に向かう
2020-06-19 2020年6月に~1.2Å分解能が達成された [crisp_bio記事はコチラ]（創薬等PF・構造生命科学ニュースウオッチ 2016/05/31）[出典] Alan Merk et al. “Breaking Cryo-EM Resolution Barriers to Facilitate Drug Discovery.” Cell. 2016 june 16;165. Publishe …
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CRISPR関連文献メモ_2016/05/30（２件）
（創薬等PF・構造生命科学ニュースウオッチ 2016/05/30）[論文] CRISPR HDR修復によって、網膜色素変性症の前臨床モデルにおける病因変異が明らかにCorresponding author: Stephen H. Tsang (Columbia U./New York-Presbyterian Hospital)網膜色素変性症のモデルマウス“ro …
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[PDIS]アラート：GATA1転写因子の転写制御は、GATA結合モチーフの配置に依存する
（創薬等PF・構造生命科学ニュースウオッチ 2016/05/30）Corresponding author: 清水律子（東北大学）GATA転写因子の中でGATA1は、多重な遺伝子の発現調節を介して、赤血球と巨核球への分化を制御している。GATA1には４種類の機能ドメイン（N末端（NTD）とC末端(CTD)にトラ …
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[PDIS]アラート：Joullié-Ugi三成分反応の機構を見直す
（創薬等PF・構造生命科学ニュースウオッチ 2016/05/30）Corresponding author: 市川 聡（北海道大学）α-置換5員環環状イミン Joullié-Ugi三成分反応（JU-3CR）のジアステレオ選択性に対する溶媒の効果を見直した。トルエン（非極性溶媒）ではcis 体を、ヘキサフルオロイ …
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[PDIS]アラート：含ブロムフェネチルアミンから六員環ベンゾラクタムへの、Pd触媒C-H結合選択的アミノカルボニル化
（創薬等PF・構造生命科学ニュースウオッチ 2016/05/30）Corresponding authors: 根東義則（東北大学）；稲本浄文（武庫川女子大学）CO環境下で、Pd触媒によりC-Br結合を維持したままブロモ基を有するフェネチルアミンの分子内C-Hを高選択性でアミノカルボニル化することで …
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CRISPR関連文献メモ_2016/05/29（３件）
（創薬等PF・構造生命科学ニュースウオッチ 2016/05/29）[論文] Cas9/gRNAの切断活性を蛍光レポーターを利用して高効率・短時間で検出：Linlin Hao (吉林大学)CRISPR/Cas9の活性の測定法には専らT7エンドヌクレアーゼI（T7E1）アッセイが利用されているが、今回、より簡便で …
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CRISPR関連文献メモ_2016/05/28（２件）
（創薬等PF・構造生命科学ニュースウオッチ 2016/05/28）[論文] CRISPRの最適標的を予測し可視化するWebサービス“CT-Finder ”Corresponding author: ：Chun Liang (Miami University)CRISPRシステム応用にあたってゲノム編集の精度と効率が課題である。CT-Finder は、高 …
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多剤耐性菌に対するlast-resort drug コリスチンに対する耐性菌、米国でも発見
（創薬等PF・構造生命科学ニュースウオッチ 2016/05/28）多剤耐性グラム陰性桿菌に対する最終手段として用いられるコリスチンに対する耐性菌mcr-1 E. coli は2015年11月に中国で発見され病原性が分析されて以来、国際的サーベイが行われ、ヨーロッパとカナダで発見されたが …
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ペプチドグリカン生合成を標的とする新たな抗耐性菌薬開発の手掛かり
（創薬等PF・構造生命科学ニュースウオッチ 2016/05/28）Corresponding author: Seok-Yong Lee (Duke University Medical Center)病原菌の細胞壁ペプチドグリカンは、抗生物質の標的である。ペプチドグリカン合成酵素の一つであるペニシリン結合タンパク質を標的とするペニ …
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Y染色体の欠損がアルツハイマー病と相関する
（創薬等PF・構造生命科学ニュースウオッチ 2016/05/27）Corresponding authors: Jan P. Dumanski; Lars A. Forsberg (Uppsala University)血球におけるY染色体欠損（loss of chromosome Y, LOY）の頻度が加齢とともに増加することが知られている。すなわち、LOYモザイク …
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がん免疫療法 - がん患者におけるがん特異的抗原の識別を、健常者のT細胞にアウトソーシング
（創薬等PF・構造生命科学ニュースウオッチ 2016/05/27）Corresponding authors: Johanna Olweus (Oslo University Hospital Radiumhospitalet); Ton N. Schumacher (Netherlands Cancer Institute (NCI)、“cancer immunogram”論文のシニアオーサー)[背景] 臨床的に有効 …
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[PDIS]アラート：Melophlus 属海綿由来テトラミン酸誘導体メロフリンの抗休眠マイコバクテリア活性と標的分子
（創薬等PF・構造生命科学ニュースウオッチ 2016/05/26）Corresponding authors：荒井雅吉；小林資正（大阪大学）Mycobacterium tuberculosis 感染症である結核（TB）で、世界中で毎年150万人が死亡している。M. tuberculosis が休眠状態で存続可能なことが、TBの感染性と …
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[PDIS]アラート：HaloTag融合標的タンパク質を、HaloTagリガンドとIAPアンタゴニストとのハイブリッド分子によって効率良くノックダウン
（創薬等PF・構造生命科学ニュースウオッチ 2016/05/26）Corresponding author：石川 稔（東京大学）既報告のHaloTag融合タンパク質の分解システム「HaloTagに共有結合するハロゲン化アルキルと、cIAP-1（Cellular Inhibitor of Apoptosis Protein 1）に結合するベスタチン誘 …
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