1.[Commentary] CRISPRシステムに基づいた血液系腫瘍の免疫療法 (CAR-T療法)
  • [出典] "Advent of CRISPR Based Immunotherapy in Hematologic Malignancies" Perez RK, Chen R, Kang R, Perez AR. J Oncopathol Clin Res 2018 Mar 30.
  • 血液系腫瘍を概観したのち、ペンシルベニア大学で進行中の「患者由来T細胞に抗癌剤に対する感受性を持たせることを目的としたNY-ESO-1 TCRの形質導入と、CRISPRシステムでPD-1およびTCRαとTCRβの発現阻害を組み合わせたCAR-T療法」の第1相試験 (NCT03399448)をハイライト
2.CRISPR/Cas9によるデュシェンヌ型筋ジストロフィー (DMD)のアカゲザルモデルにおけるオフターゲット変異誘発を検証
  • [出典] "No off-target mutations in functional genome regions of a CRISPR/Cas9-generated monkey model of muscular dystrophy" Wang S [..] Chen Y. J Biol Chem 2018 Jun 25.
  • 深度 60xの全ゲノムシーケンシング (WGS)でSNVsとindelsの存在を解析し、CRISPR/Cas9で生成したアカゲザルDMDモデルのコーディング領域にはオフターゲット編集が発生していないことを確認。
3.CRISPR/Cas9を介して、筋強直性ジストロフィータイプ1 (DM1)患者由来のiPSおよび筋原細胞の3塩基リピート伸長を効率的に編集
  • [出典] "Efficient CRISPR/Cas9-mediated editing of trinucleotide repeat expansion in myotonic dystrophy patient-derived iPS and myogenic cells" Dastidar S [..] Chuah MK, VandenDriessche T. Nucleic Acids Res. 2018 Jun 27.
  • DM1患者由来細胞においてヒトの筋強直性ジストロフィープロテインキナーゼ遺伝子 (DMPK)の3'UTRにおけるCTGリピート伸長をデュアルgRNAとCRISPR/Cas9のRNP送達により効果的に切り出し、遺伝子修復率90%を達成した。また、この編集によって、DM1-iPSC、DM1-iPSCから分化した筋原細胞およびDM1筋原細胞からDM1の典型的細胞表現型が消滅した。
4.[レビュー]癌研究へのCRISPR-Cas9の応用:癌遺伝子同定から臨床治療まで
  • [出典] "Exposing cancer with CRISPR-Cas9: from genetic identification to clinical therapy" Fan P, He ZY, Xu T, Phan K, Chen GG, Wei YQ. Transl Cancer Res 2018 Jun.
  • 癌遺伝子同定;遺伝子ノックアウトと機能ゲノミクス;癌療法のドラッガブル・ターゲット同定;癌研究の細胞モデルまたは動物モデルの作出;癌のin vivo遺伝子治療;癌の細胞療法;癌療法の臨床試験 (Table 1に11件を網羅);課題と将来展望
5.[レビュー]遺伝子工学と合成生物学のためのCRISPR-dCasツールボックス
  • [出典] "A CRISPR-dCas Toolbox for Genetic Engineering and Synthetic Biology" Xu X, Qi LS. J Mol Biol 2018 Jun 26.
  • UCSF時代にCRISPRa開発に参画し、CRISPRiを主導したStanley Qi (UCSF; 現スタンフォード大学)を責任著者とするレビュー:CRISPR-dCas9に基づくツールを利用した転写調節 (第1世代のCRISPRiとCRISPRa;複雑なタンパク質とsgRNA改変による第2世代;化合物や光による活性誘導およびリガンド結合による誘導に基づく分子入出力装置) ;エピゲノム制御、ゲノムの可視化、遺伝子スクリーニング、ChIPと組み合わせた調節因子の同定をハイライト
6. プール型CRISPRスクリーニングは、機能ゲノミクスの新時代の兆し
  • [出典] "Is Pooled CRISPR-Screening the Dawn of a New Era for Functional Genomics" Yao J, Dai HL. Adv Exp Med Biol. 2018;1068:171-176
  • CRISPRとscRNA-seqを組み合わせたCROP-seq、Perturb-seqおよびCRISPR-seqをハイライト
  • 関連crisp_bio記事:CRISPRメモ_2018/02/05 - 1. CRISPR/Cas9遺伝子編集結果を単一細胞RNA-seq(scRNA-seq)で読み出す順遺伝学スクリーン法の改善
7. DeepCRISPR:深層学習によるCRISPR gRNAの最適設計
  • [出典] "DeepCRISPR: optimized CRISPR guide RNA design by deep learning" Chuai G, Ma H, Yan J, Chen M, Hong N, Xue D, Zhou C, Zhu C, Chen K, Duan B, Gu F, Qu S, Huang D, Wei J, Liu Q. Genome Biol 2018 Jun 26. (原論文 Fig. 1を以下に引用)DeepCRISPR
  • sgRNAのオンターゲット編集効率とオフターゲットサイト編集プロファイルを包括的に推定;当面、ヒトゲノムにおけるSpCas9による遺伝子編集に限定
  • Webサイト:http://www.deepcrispr.net/
8.黒リンナノシートによりCRISPR/Cas9の細胞質への送達とリリースを亢進