1. [特許]真核生物のシーケンス操作のためのCRISPR-Casシステム、手法および組成
2. CRISPR-Cas9 RNPの新たな送達法'VEsiCas'小胞
  • [出典] "VSV-G-Enveloped Vesicles for Traceless Delivery of CRISPR-Cas9" Montagna C [..] Cereseto A. Mol Ther Nucleic Acids 2018 Jul 11.
  • VEsiCasは、細胞質においてT7 RNAポリメラーゼを介して合成するsgRNAとSpCas9タンパク質との複合体RNPを取り込んだ、水疱性口炎ウイルスの膜融合Gタンパク質（Vesicular Stomatitis Virus Glycoprotein：VSV-G）で修飾した小胞である(論文ではVEsiCas産生細胞としてBSR-T7/5細胞を利用している）。
  • オフターゲット作用を抑制するなどを目的としてSpCas9の活性を一時的に発生させるためにRNPをエレクトロポレーションする手法が使われている。VEsiCasは、外来DNAやウイルスの痕跡を伴うことなく、エレクトロポレーション法よりも、ヌクレアーゼをより効率良く送達する。
  • VEsiCasは毒性が低く、さまざなま形質転換細胞、iPSCs、心筋細胞およびin vivoの遺伝子編集に有効である。複数sgRNAを組み込むことによる多重化も可能である。
3. タイプIII-A CRISPR-Casシステムによる抗プラスミド免疫は、Csm6のリボヌクレアーゼ活性を必要とする
  • [出典] "The ribonuclease activity of Csm6 is required for anti-plasmid immunity by Type III-A CRISPR-Cas systems" Foster K, Kalter J, Woodside W, Terns RM, Terns MP. RNA Biol 2018 Jul 11.
  • E. coliで発現させたLactococcus lactis, Staphylococcus epidermidisおよびStreptococcus thermophilusのタイプIII-A CRISPR-Casシステムを解析し、Csm1を介したデオキシリボヌクレアーゼではなく、Casm6のリボヌクレアーゼ活性によって、抗プラスミド免疫応答が誘導されることを明らかにした
4. タイプII CRISPR-CasシステムにおけるtracrRNAsの推定と多様性
  • [出典] "Prediction and diversity of tracrRNAs from type II CRISPR-Cas systems" Chyou T, Brown CM. RNA Biol 2018 Jul 11.
  • TracrRNAは、短い(3-6 bp)ステムや独特の塩基対(G-A)を有しin silicoでの予測が困難であった。'RefSeq representative genomes'から推定した165種類の属由来の275種類のtracrRNAsを、StreptococciおよびStaphylococciのtracrRNAsがメンバーであるクラスターを含む 15種類のクラスターに分類。
5. CRISPR/Cas9システムによるPrkdcとIL2Rの２遺伝子破壊によって、新世代NSGマウスを作出
  • [出典] "Generation of a new strain of NOD/SCID/IL2Rγ-/- mice with targeted disruption of Prkdc and IL2Rγ genes using CRISPR/Cas9 system" (in Chinese). Liu YC, Chen Q, Yang XL, Tang QS, Yao KT, Xu Y. 南方医科大学学报 (Nan Fang Yi Ke Da Xue Xue Bao). 2018 Jun 20.
  • 現行NSGにおけるPrkdc遺伝子の自然突然変異由来のSCID変異に替えて、CRISPR/Cas9による２遺伝子のノックアウトにより、T細胞、T細胞およびNK細胞を完全に欠損したNSGマウス(Chinese NSG; cNSG)を作出した。
6. [レビュー]CRISPRによる作物品種改良の最新動向
  • [出典] "CRISPR for Crop Improvement: An Update Review" Jaganathan D, Ramasamy K, Sellamuthu G, Jayabalan S, Venkataraman G. Front Plant Sci 2018 Jul 17.
  • CRISPR/Cas9ゲノム編集技術の進歩；単子葉植物品種改良；双子葉植物品種改良；ゲノム編集産物の規制
  • 下図：左は2005-2018の間のゲノム編集技術論文とレビュー刊行数動向；右は、CRSIPRによる植物ゲノム編集動向
CROP 1 CROP 2
7. CRISPR/Cas9を介したタバコにおける遺伝子ターゲティング
  • [出典] "CRISPR/Cas9-mediated homologous recombination in tobacco" Hirohata A, Sato I, Kaino K, Iwata Y, Koizumi N, Mishiba K. Plant Cell Rep 2018 Jul 13.
  • これまで、CRISPR/Cas9が誘導するDSBのNHEJ修復によるタバコのゲノム編集は先行例があるが、相同組換え(HR)を介した遺伝子改変の報告は未だ無い。大阪府立大学の研究チームは今回、互いに独立な２種類のT-DNA領域または３種類のT-DNA領域からなるバイナリーベクターによって、相同組み換えを実現した。
8. CRISPR-Cas9技術による黒穂病菌  (Ustilago trichophora)のマーカー・フリー・ゲノム編集
  • [出典] "Marker-free genome editing in Ustilago trichophora with the CRISPR-Cas9 technology" Huck S, Bock J, Girardello J, Gauert M, Pul Ü. RNA Biol 2018 Jul 12. 
  • イヌビエ(Echinochloa crus-galli)  由来黒穂病菌においてNHEJを介した遺伝子ノックアウトと、HRを介した改変を実現
9. 多細胞生物である藍藻のCRISPR-Casシステム
  • [出典] "CRISPR-Cas Systems in Multicellular Cyanobacteria" Hess WR, Hou S, Brenes-Álvarez M, Reimann V, Alkhnbashi OS, Backofen R, Muro-Pastor AM. RNA Biol 2018 Jul 11.
  • 171種類の公開ゲノムを元に、藍藻におけるCRISPR-CasシステムとCRISPR様アレイとタイプと多様性を分析。
10. 肺炎桿菌Klebsiella pneumoniae 臨床分離株におけるCRISPR-Casシステムと抗生物質感受性の相関 
  • [出典] "Characterization of CRISPR-Cas Systems in Clinical Klebsiella pneumoniae Isolates Uncovers Its Potential Association With Antibiotic Susceptibility" Li H-Y, Kao C-Y, Lin W-H, Zheng P-X, Yan J-J, Wang M-C, Teng C-H, Tseng C-C and Wu J-J. Front Microbiol 2018 Jul 16.
  • バクテリアやファージを排除するCRISPRシステムと、バクテリアとファージを介した水平移動による抗生物質耐性の獲得のバランス；
  • Integrated Microbial Genomes & Microbiomes genomeから抽出した97株と、台湾の患者由来176臨床分離株のゲノムを解析し、MLST法によるゲノムタイピングと整合する２種類のCRISPR-Casシステム(I-EとI-E*)の系統に分類できることを見出した；I-E*システムの菌株は抗生物質体制を帯びたファージとプラスミドの感染により干渉し結果的に抗生物質感受性が高い；公開されている多剤耐性K. pneumoniae菌ゲノムにははCRISPR-Casが見出されていない。
11. 医療廃棄物溶液とベリガンガ川(バングラデッシュ)由来のバクテリア分離株におけるCRISPRシステムと抗生物質耐性の相関
  • [出典] "Investigation of the Potential Association between Clustered Regularly Interspersed Short Palindromic Repeats (CRISPR) and Antibiotic Resistance Pattern of Bacterial Strains Isolated from Medical Waste and Environmental Water" Alam S, Chakraborty S, Rahman T, Hosen I, Paul A, Hasan AKM, Hossain MA. Open J Med Microbiol 2018 Jun 29.
  • バクテリアやファージを排除するCRISPRシステムと、バクテリアとファージを介した水平移動による抗生物質耐性の獲得のバランス；分離株を16S rDNAで同定し、抗生物質耐性の評価、CRISPR遺伝子座の同定を試み、多剤耐性菌にはCRISPR遺伝子座を見いだすことがなかった。