1. [特許] 高精度なCas9ゲノム編集を実現するキメラ(DNA:RNA)ガイド
- US2018/0282722；公開日10/04/2018. 発明者 Jakimo N, Chatterjee P, Jacobson JM. 権利者 MIT.
- Cas9 gRNAの一部をDNAに置換したmismatch-evading lowered-thermostability guides (melt-guides)を利用することでオフターゲット編集を抑制し高精度なゲノム編集を実現
- 関連論文："Chimeric CRISPR guides enhance Cas9 target specificity" Jakimo N, Chatterjee P,Jacobson JM. bioRxiv. Posted 2017 Jan 8.
- 類似論文：CRISPRメモ_2018/05/16 - 2 3.crRNAの一部をDNAに置換えたキメラ・ガイドがCas9の生化学的活性を亢進する；"Chimeric Guides Probe and Enhance Cas9 Biochemical Activity" Kartje ZJ, Barkau CL, Rohilla KJ, Ageely EA, Gagnon KT. Biochemistry. 2018 May 14.
2. CRISPRiとiPS細胞を組み合わせて、時空間的にモザイクな形態形成をモデリング
[出典] "Spatiotemporal mosaic patterning of pluripotent stem cells using CRISPR interference" Libby AR, Joy DA, So PL, Mandegar MA, Muncie JM, Mendoza-Camacho FN, Weaver VM, Conklin BR1, McDevitt TC. eLife. 2018 Oct 9. (bioRxiv. 2018-01-24)
- UCSF, UC BerkeleyならびにUCの研究チームは、モデル動物では精密な再現が困難なヒトの形態形成のモデルシステム構築を目指して、ヒトiPS細胞 (hiPSCs)の亜集団の機械的混合が自己組織化するか、検証を進めた。
- 細胞接着と細胞膜張力を調節するE-カドヘリン(CDH1)とROCK1を標的とする誘導可能なCRISPRiを注入した細胞集合と注入していない細胞集合を混合した後、CRISPRiの活性を誘導することでCDH1とROCK1のモザイク・ノックダウンの集合を生成し、多能性を維持したまま、それぞれ自己組織化することを見出した（原論文Figure 1と5を運用した下図左と下図右参照）。
3. 大規模なヒト化 (25-kbp)マウス系統を確立
[出典] "Viable Mice with Extensive Gene Humanization (25-kbp) Created Using Embryonic Stem Cell/Blastocyst and CRISPR/Zygote Injection Approaches" Leidy-Davis T, Cheng K, Goodwin LO, Morgan JL, Juan WC, Roca X, Ong ST, Bergstrom DE. Sci Rep. 2018 Oct 9.
- ES細胞/胚盤胞のBac recombineeringとCRISPR/接合子マイクロインジェクションの２種類の手法で下図の大規模ゲノム領域置換を実現；マウスBcl2l11遺伝子の17-kbpを、ヒトのBCL2L11の25-kbp長セグメントで置換
4. [ビデオプロトコル] CRISPR-Cas9による哺乳類ゲノム編集用RNAのクローニング法
"CRISPR Guide RNA Cloning for Mammalian Systems"
Nageshwaran S, Chavez A, Cher Yeo N, Guo X, Lance-Byrne A, Tung A, Collins JJ., Church GM. J Vis Exp. 2018 (140), e57998
5. [Commentary] 宿主と病原体の相互作用：宿主因子のゲノムワイドスクリーンから分かること
[出典] "Host-Pathogen Interactions: What the EHEC Are We Learning from Host Genome-Wide Screens?" Lynch JP, Lesser CF. mBio. 2018 Oct 9.
- 腸管出血性大腸菌の感染に関わる宿主因子について、2018年5月にbioRxivに投稿されたCRISPR/Cas9機能喪失スクリーンの結果(*)と過去のゲノムワイドスクリーン3論文の結果を比較し、いずれもが複数の宿主因子が病原体の感染に関与するとしながらもその宿主因子にほとんど一致が見られないことから、各スクリーニングの長所と短所を論じ、フォローアップ研究を提案
- (*) CRISPRメモ_2018/05/09 - 1 4. CRISPR/Cas9による機能喪失スクリーンにより腸管出血性大腸菌 (EHEC)の病原性因子であるIII型分泌装置 (T3SS)と志賀毒素 (Stx) に共通する宿主因子を同定；"CRISPR screen reveals that EHEC's T3SS and Shiga toxin rely on shared host factors for infection" Pacheco AR [..] Waldor MK. bioRxiv. Posted May 8, 2018.
6. [レビュー]病原菌におけるCRISPR-Casシステムの多彩な機能
[出典] "CRISPR-Cas system in regulation of immunity and virulence of bacterial pathogens"
Ahmed W, Hafeez MB, Ahmad R, Mahmood S. Gene Reports 2018 Oct 9.
- CRISPR-Casシステムと獲得免疫応答以外の機能、生理機能、環境ストレス応答、病原性、および進化との関連をレビュー
7. [解説]マラリアを媒介する蚊の遺伝子ドライブによる防除と懸念
[出典] "CRISPR and the Ethics of Gene Drive in Mosquitoes" Rulli T. (2018) In: Boonin D. (eds) The Palgrave Handbook of Philosophy and Public Policy. 2018 Oct 9.
- 最大の関心事は遺伝子ドライブの環境とヒトの健康に対する影響
8. CRISPR技術の利用については、治療を目的とする利用を認め、機能強化を目的とする利用は認めない、考え方が主流であるが、治療と強化の判定は可能なのか？
[出典] "Challenging the Therapy/Enhancement Distinction in CRISPR Gene Editing" Augustin R, Gouw AM. In: Boonin D. (eds) The Palgrave Handbook of Philosophy and Public Policy. 2018 Oct 9.
- "normal"とは何か改めて考察することが必要
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