crisp_bio

科学分野の比較的新しい論文と記事を記録しておくサイト: 主に、CRISPR生物学・技術開発・応用 (ゲノム編集, エピゲノム編集, 遺伝子治療, 分子診断/代謝工学, 合成生物学/進化, がん, 免疫, 老化, 育種 - 結果的に生物が関わる全分野) の観点から選択し、時折、タンパク質工学、情報資源・生物資源、新型コロナウイルスの起源・ワクチン・後遺症、機械学習・AIや研究公正からも選択

[出典] "CRISPR-Sirius:RNA scaffolds for signal amplification in genome imaging" Ma H,Tu LC, Naseri A, Chung YC, Grunwald D, Zhang S, Pederson T. Nat Methods. 2018 Oct 30. ("CRISPR-Based DNA Imaging in Living Cells Reveals Cell Cycle-Dependent Chromosome Dynamics" bioRxiv 2017-09-29)
  • 多重MS2アプタマーを利用する蛍光標識法を改良したCRISPR-sgRNA Siriusを開発:sgRNA鎖への八連のRNAアプタマーMS2の挿入位置を最適化;各MS2に変異を導入し、ウイルス形質導入の際の多重MS2のミスフォールディングや組み換えを最小限に (sgRNA-Sirius-8XMS2: 原論文 Supplementary Fig. 3c & Supplementary Fig. 4参照)
  • CRISPRainbowやsgRNA-3′-14XMS2などから性能向上:低コピー数の標的の可視化;ヒトU2OS細胞内で第19染色体上のkilobasesからmegabasesの間隔の標的ペア、ひいては染色体の動態、を可視化
  • Pedersonチーム成果 関連crisp_bio記事:2017-04-29 CRISPR/Cas9で細胞内動態を直接観察
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