1. 一塩基編集(Base editing): 生細胞のゲノムとトランスクリプトームの精密化学
[REVIEW]Base editing: precision chemistry on the genome and transcriptome of living cells. Rees HA, Liu DR. Nat Rev Genet. 2018-10-15.
- これまでに、DSBを介さずにDNAとRNAへの点変異導入を可能とするbase editors(BE1/2/3/4; BE4max; AncBE4max; ABE; ABEmax)開発を先導し、ディープラーニングに基づくモデルによりNHEJ/MMEJを介した1-bp挿入と病因変異修復も実現したDavid R. LiuとLiu研のHolly Reesによる一塩基編集技術の最新動向レビュー、現時点での課題と解決法も詳述；Table 1にBEの網羅的リストあり
2. マウス胚において、シトシンBE(CBE)とアデニンBE (ABE)の高精度編集を検証
"Targeting fidelity of adenine and cytosine base editors in mouse embryos" Lee HK, Willi M, Miller SM, Kim S, Liu C, Liu DR, Hennighausen L. Nat Commun. 2018-11-15.
- マウス胚において、222アレルを標的とするCBE (HF2-BE2; BE3; saBE3; VQR-BE3; BE4)と214アレルを標的とするABEの編集結果を、オンターゲット編集 (設計通りの~5 bpウインドウ内)、バイスタンダー編集 (ウインドウの外かつプロトスペーサ内)、近位(proximial)オフターゲット編集(プロトスペーサの上流または下流200 bp内)に分類、200 bpを超える遠位でのオフターゲット編集は未評価 (原論文Fig. 1引用下図参照)；ABEの高精度に注目。
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