(創薬等PF・構造生命科学ニュースウオッチ 20160404)
- Corresponding authors: David Hill (CCSB, Dana‐Farber Cancer Inst.); Stefan Wiemann (DKFZ); Matthias Harber (RIKEN); Marc Vidal (Dana‐Farber Cancer Inst.); Joshua Labaer (Arizona State U.)
- 28組織が参画している国際共同事業 ORFeome Collaboration(以下, OC)の成果。日本からは理研、かずさDNA研究所ならびにDNAFORMが参加.
- [規模] 17,154遺伝子のORFsを網羅(RefSeqヒト遺伝子の73%に相当する15,202遺伝子;Ensemblヒト遺伝子の71%相当の15,746遺伝子;RefSeqとEnsamlに共通する遺伝子の79%に相当する13,794遺伝子;キュレーションされたConsensus Coding DNA sequence Project (CCDS)ヒト遺伝子の79%に相当)
- [由来] Mammalian Gene CollectionまたはGerman cDNA ConsortiumのcDNA
- [クローン提供] Gatewayベクターで提供;5’UTRと3’UTRは全て削除;ストップコドン64%無し、31%有り無し双方
- [データ提供] クローンの配列は国際塩基配列データバンク(DDBJ/EMBL/Genbank)に登録済み;OC独自にもアノテーション付配列データ提供;国内提供元は、かずさ研究所バイオリソース普及センターDNAFORM(ダナフォーム)
- [利用例] Human Interactive Database (Cell 2014)、アデリニル化(AMPylation)研究用タンパク質アレイの構築(Nature Protocols 2015)など多種多様
- [その他] 遺伝子のカバー率を上げ、アイソフォームや疾患関連変異遺伝子を拡充し、さらにアフリカツメガエルやショウジョウバエなど対象生物種を拡張.
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