1. プール型CRISPRaにより抗体および内因性リガンドに対する細胞表面受容体をハイスループットで同定
[出典] "Pooled extracellular receptor-ligand interaction screening using CRISPR activation" Chong ZS, Ohnishi S, Yusa K, Wright GJ. Genome Biol. 2018 Nov 26;19(1):205.
- CRISPRa (dCas9と転写活性化因子を融合したシステムによる遺伝子転写活性化 (原論文Fig. 1から引用した下図左 a)を利用することで、細胞表面受容体の過剰発現を実現 (下図左b参照)
- 膜貫通領域を帯びていることが予測されているタンパク質をはじめとして細胞膜と相関するエビデンスがあるタンパク質をコードする全ての遺伝子のプロモーターを標的とするプール型sgRNAsのライブラリーを構築し、CRISPRaでのゲノムワイドスクリーニングを実現 (原論文Fig. 2から引用した上図右参照);低親和性の受容体-内因性リガンド相互作用同定、創薬標的でありながら活性化リガンドがほとんど同定されていないAdhesion型GPCRsのリガンド同定 (ミエリンインヒビターNogoタンパク質のリガンドADGRB1を同定)
2. [特許] HNHまたはRuvCを不活性化したCas9ニッカーゼ一対の利用による精密ゲノム編集
[出典] US2018/0327761 "Method for Producing Precise DNA Cleavage using Cas9 Nickase Activity".
公開日 11/15/2018;発明者 Duchateau P, Bertonati C;権利者 Cellectis (Paris, FR)
公開日 11/15/2018;発明者 Duchateau P, Bertonati C;権利者 Cellectis (Paris, FR)
3. ヒト細胞におけるゲノムワイドCRISPR-Cas9機能喪失スクリーンにより、志賀毒素とリシンの毒性を仲介する宿主因子として、新たにゴルジ体タンパク質を同定 (原論文Fig.1引用下図 F参照)
[出典] "Genome-wide CRISPR screens for Shiga toxins and ricin reveal Golgi proteins critical for glycosylation" Tian S [..] Dong M. PLoS Biol. 2018 Nov 27;16(11):e2006951.
4. ティラピアのノンコーディング配列を高効率で標的するCRISPR/Cas9システム
[出典] "High Efficiency Targeting of Non-coding Sequences Using CRISPR/Cas9 System in Tilapia" Li M, Liu X, Dai S, Xiao H, Wang D. G3 (Bethesda). 2018 Nov 27.
- Cas9と1~2gRNA(s)によりマイクロRNAと3'UTRも含むノンコーディング配列の選択的欠損をティラピアで実現;受精卵において2箇所の遺伝座の間の断片を一対のgRNAsとCas9により11%の効率で実現し、さらに、ssDNAをドナーとすることで、効率を19%へと向上;次世代への伝達効率平均8.7%を達成し、vasa 3'UTRを標的とするCas9により伝達効率14.8%へと向上
5. 新奇CRISPR-Cas12bによるヒトおよびマウスゲノム編集
[出典] "Repurposing CRISPR-Cas12b for mammalian genome engineering" Tang F, Cui T [..] Wei L. Cell Discovery. 2018-11-27.
- Cas12b (C2c)は40 °Cより高温で活性を示すとされていたが、中国科学院の研究チームは今回、Cas12aと異なり31 °C–59 °Cと広い温度域で活性を示すCas12bをAlicyclobacillus acidiphilusから同定した。この AaCas12bは、Cas12aと異なりcrRNA/tracrRNA二重鎖で誘導され、5′-TTNをPAM配列とし、切断部位に粘着末端をもたらす。
- AaCas12bによる多重ゲノム編集、遺伝子活性化および遺伝変異マウスモデル作出を実証し、全ゲノムシーケンシングではオフターゲット編集が検出されないことを確認した。
- AaCas12bは、広い温度域に加えて広いpH値域で活性を示し、また、そのRNPがヒト血漿内で安定しているという特徴を備えている。
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