• 富井健太郎(ゲノム機能情報研究グループ/創薬基盤研究部門/産業技術総合研究所)
  • タンパク質のアミノ酸配列の類似性検索はタンパク質の構造・機能推定の基本である。MIQS(Matrix to Improve Quality in Similarity search)は高感度な遠縁類似配列検索に適したア ミノ酸置換行列である。
  • BLOSUMを代表とする既存のアミノ酸置換行列を対象とする主成分分析(PCA)から抽出するアミノ酸置換行列をベンチマークし、カーネル密度推定に拠ってPCAの3次元空間における高感度領域を特定し、新奇アミノ酸置換行列を導出。
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