1. [レビュー]CRISPR技術による作物ゲノム編集の課題と解決
[出典] REVIEW "Now for the hard ones: is there a limit on CRISPR genome editing in crops?" Botella JR. J Exp Bot. 2019-02-05.
- CRISPR/Cas9による変異誘発実験が困難な植物への取り組み方について原論文Box. 1引用下図参照
2. CRISPR/Cas9による萎凋病菌Fusarium oxysporumの内在遺伝子標識
[出典] "CRISPR/Cas9-mediated endogenous gene tagging in Fusarium oxysporum" Wang Q, Coleman JJ. Fungal Genetics and Biology. 2019-02-06.
- Auburn Universityの研究チームは今回、植物/動物/ヒト病原菌であるF. oxysporumの調節因子や毒性因子の細胞内局在を、CRISPR/Cas9によるDSBからの修復における相同組み換えに依存しない過程を利用するノックイン (homology-independent targeted integration, HITI)と相同組み換えを利用するノックイン(homology-dependent recombination integration, HDRI )で、タギングすることで解析した。HITIでFoChs5遺伝子の局在を、HDRIでFoSSO1とFoSSO2のパラログ遺伝子の局在を同定した。
- HITI法関連crisp_bio記事：2017-05-06 非相同末端結合（NHEJ）によって、in vivoで非分裂細胞に外来遺伝子をノックイン
3. コウジカビ遺伝子の効率的なノックアウトと置換にCRISPR/Cas9を最適化
[出典] "Efficient gene deletion and replacement in Aspergillus niger by modified in vivo CRISPR/Cas9 systems" Zhang Y, Ouyang L, Nan Y et al. Bioresour. Bioprocess. 2019-02-04.
- 糸状菌で広く利用されているプラスミドpAN7-1の利用と、gRNAの変更を容易にする"ribozyme-gRNA-ribozyme (RGR)"を組み込むことで (原論文Fig.1とFig.2引用下図参照)、90%の編集効率を実現した。
- また、相同アームの長さ100-bpのドナーテンプレートによるHDRを介して、１段階でのKO/KIを実現した。
4. ビブリオ菌ではCRISPR-Casシステムが主として可動遺伝因子 (MGEs)に存在する
[出典] "CRISPR-Cas systems are present predominantly on mobile genetic elements in Vibrio species" McDonald ND, Regmi A, Morreale DP, Borowski JD, Fidelma Boyd E. BMC Genomics. 2019-02-04.
- 70のビブリオ種で多様なCRISPR-Casシステムを同定した。その多くが、ゲノムアイランド、プラスミドおよびとランスポゾン様エレメントに存在した。
コメント