(創薬等PF・構造生命科学ニュースウオッチ 2016/06/05)
  1. [論文] クラス2タイプVI-A CRISPR/CasエフェクターC2c2の標的は一本鎖RNAである
    • Omar O. Abudayyeh et al. “C2c2 is a single-component programmable RNA-guided RNA-targeting CRISPR effector.” Science. Published online 2016 Jun 2.
      Corresponding authors: Eugene V. Koonin (NCBI);Feng Zhang (Broad/MIT)
    • E. V. KooningとF. Zhangらは2015年に、微生物ゲノムデータベースからCRISPR/Casローカスを網羅的に探索し、クラス2に属する新たなCas候補(C2c1; C2c2; C2c3)を同定し、CRISPR/Casシステムのクラス2をタイプⅡ (Cas9)、タイプⅤ (Cpf1, C2c1, C2c3)およびタイプⅥ (C2c2)で構成されるとした。今回、その中でLeptotrichia shahii 由来のC2c2の特性を解析した。
      • C2c2を移植したE. coli は、ssRNAウイルスであるバクテリオファオージMS2に対して免疫応答を示した。
      • C2c2はtracrRNAをともなわない単独のcrRNAにガイドされて、プロトスペーサーに相補的なssRNAを切断するRNA分解酵素である。
      • 標的のssRNAへの結合によって活性化したC2c2は、in vitro においてcrRNAに非相補的なRNA分子、宿主のRNA、を分解し、in vivo で細胞死の誘導または細胞を休眠状態へ誘導する。
      • C2c2は、外来ファージ以外に、宿主バクテリアの特定のmRNAsをノックダウンするようにプログラム可能である。
      • C2c2は、保存されている2つのHEPNドメインの塩基性残基によって標的を切断する。
    • HEPNドメインに変異を導入し、触媒活性を欠失したRNA結合タンパク質dC2c2を作出。野生型C2c2とdC2c2によって、RNAとその転写物の可視化や操作の手法が大きく広がることになる。
    • また、C2C2には、特定の転写物を発現しているがん細胞、特定のクラスの神経細胞あるいは特定の病原体が感染した細胞を、細胞死または休眠状態へと誘導できる可能性がある。
  2. [論文] CRISPR/Casシステムによるゼブラフィッシュにおける多重な条件付き突然変異誘発
  3. [コメント] アルゴノート(Argonaute(Ago))ってどうよ?