（創薬等PF・構造生命科学ニュースウオッチ 2016/08/07）CRISPR関連文献メモ_2016/08/07
- Corresponding author: John van der Oost (Wageningen University)
- CRISPR/Casシステムによる獲得免疫機構は、原核生物ゲノムのほぼ半分に存在する。CRISPR/Casシステムは、ウイルスやファージと宿主との間の果てしない軍拡競争の中で、CRISPR/Casシステム全体あるいはそのモジュールの水平移動を介して、進化してきた。その結果、CRISPR/Casシステムは構造上も機能上も極めて多様であり、現在、クラス１とクラス２に大分類され、それぞれに３タイプの存在が知られており*1)、さらにサブタイプが判別されている。
*1)クラス１ - タイプ I／III／IV；クラス２ - II／V／VI - エフェクターCmrの結晶構造を明らかにした*2)J. van der Oostらは、今回、CRISPR/Casシステムの分子機構と進化に関する研究の進展と、その応用展開をレビュー（引用論文数166編）
*2)Cmr構造解析論文："Structure and activity of an RNA-targeting Type III-B CRISPR-Cas complex in Thermus thermophilus” Molecular Cell, 2013. - 構成
- CRISPR/Casシステムによる可動遺伝要素（mobile genetic elements, MGEs）に対する防御の分子機構と進化過程（図１と図２）
- CRISPRアレイにMGEs由来のスペーサーが埋め込まれる過程を免疫記憶を獲得する分子機構（CRISPR adaptation）（図３）
- crRNAsの生合成機構（図４と図５）
- 標的に対する干渉の分子機構（図６）
- ゲノム編集への応用
- CRISPR/Casに関しては、免疫システムとウイルスの共進化、CRISPR/Casの活性と遺伝子水平移動の関連、および、CRISPR/Casシステムの獲得免疫反応以外の機能も興味深い課題であるが、そのレビューは他に譲る。
- CRISPR/Casシステムの多様性関連ニュースウオッチ記事
- CRISPR関連文献メモ_2016/06/05 1.[論文]クラス2タイプVI-A CRISPR/CasエフェクターC2c2の標的は一本鎖RNAである：E. V. Koonin (NCBI)；F. Zhang (Broad/MIT) Leptotrichia shahii 由来のC2c2はCRISPR/Casシステムのクラス２に分類され、crRNAに誘導され、一本鎖RNAを切断するRNase（リボヌクレアーゼ）である。
- CRISPR関連文献メモ_2015/10/04 1.[論文] CRISPR/Casシステム進化分類の改訂-新たなゲノム編集ツールの発見へ： E. V. Koonin (NCBI)
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