crisp_bio

論文・記事紹介:CRISPR生物学・技術開発・応用 (ゲノム工学, エピゲノム工学, 代謝工学/遺伝子治療, 分子診断/進化, がん, 免疫, 老化, 育種 - 結果的に生物が関わる全分野); タンパク質工学;情報資源・生物資源;新型コロナウイルスの起源・ワクチン・後遺症;研究公正

[出典] "Single-cell analysis of a mutant library generated using CRISPR-guided deaminase" Jun S, Lim H, Lee JH, Bang D. bioRxiv. 2019-04-18.
  • GeCKO ライブラリーを利用したゲノムワイドCRISPR/Cas9ノックアウト/活性化スクリーンに替えて、プール型sgRNAsライブラリーに基づくBE3スクリーンとCROP-seqを組み合わせて、多重遺伝子への一塩基変異 (SNVs)の導入と解析を可能とするプラットフォームを開発した。
  • 実証実験として、420 sgRNAsのライブラリーを構築し、メラノーマ患者におけるBRAF V600E変異を標的とするベムラフェニブに対する耐性遺伝子3種類 (MAP2K1, KRAS, NRAS)の各エクソンにSNVsを導入し、ベムラフェニブに対する耐性をもたらす点変異を同定し、耐性獲得クローンの遺伝子発現特性を特定した。
 CRISPRスクリーンとsgRNA-seq参考記事
  • *CRISPRメモ_2018/02/05 1. CRISPR/Cas9遺伝子編集結果を単一細胞RNA-seq(scRNA-seq)で読み出す手法一覧
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