[出典]  "FLASH - a next-generation CRISPR diagnostic for multiplexed detection of antimicrobial resistance sequences" Quan J, Langelier C, Kuchta A [..] Crawford ED. Nucleic Acids Res 2019-05-22;特許公開 US20190300935A1 Method for finding low abundance sequences by hybridization (FLASH).
  • FLASHは、"Finding Low Abundance Sequences by Hybridization"に由来する。
  • 多剤耐性菌は今や世界的な脅威であるが、メタゲノムにおける薬剤耐性遺伝子は相対的に極めて少量なため、次世代シーケーシング (NGS)解析で検出するのは容易ではない。
  • UCSFを中心とする米国、英国、ナミビアの共同研究グループは、Cas9ゲノム編集技術によっ、設定した配列セットをエンリッチした上で、NGS解析するFLASH-NGS法を開発し (下図左のFigure 1参照)、サブアトモル濃度の遺伝子検出を実現し、FLASH用のgRNA設計ツールFLASHitを公開した (github.com/czbiohub/flash)。
  • 実証実験は患者由来の気道液 (下図左のFigure 3参照)と、乾燥血液 (下図右のFigure 4参照)で行なったが、FLASH-NGSはマルチプレックスPCRに依存するあらゆる解析を高速かつ精密にする。
FLASH 1 FLASH 2