(創薬等PF・構造生命科学ニュースウオッチ 2016/11/15)
- Corresponding authors: Mihai G. Netea (Radbound U. Medical Center); Ramnik J. Xavier (Broad Inst./Massachusetts General Hospital/MIT)
- ヒト腸内マイクロバイオームの異常(dysbiosis)は免疫応答の異常と密接な関係にあり、しばしば炎症性サイトカインの過剰生産を伴う。研究チームは、Human Functional Genomics Project(HFGP)の一環として、健常な489人について、腸内マイクロバイオーム(gut microbiome: 以下、GM)の組成(微生物種)ならびに機能と、5種類の微生物刺激に対するサイトカイン応答のデータをデータベース化し、解析した。
- 5種類の微生物刺激は、Escherichia coli 由来の精製リポ多糖(LPS)、グラム陰性菌Bacteroides fragilis、グラム陽性菌Staphylococcus aureus、および、Candida albicans の菌糸と分生子、とした。
- GMとサイトカインの相互作用のパターン(interaction pattern: IP)を3種類のクラス(IP1〜IP3)に分類した:IP1は微生物刺激に特異的;IP2はサイトカイン特異的;IP3は特定の微生物刺激とサイトカインの組み合わせに特異的。
- 病原菌に誘導されるサイトカイン産生については、IFNγ産生とトリプトファンのトリプトフォールへの分解経路の間に負の相関が存在し、TNFα産生とパルミトレイン酸生合成ならびにcis-バクセン酸生合成との間に正の相関が存在することを同定した。
- HFGPの一環として行われている「免疫疾患の病因解明を目的とする免疫応答と環境因子ならびに遺伝因子の統合的解析」研究関連記事および論文
- Mihai G. Netea et al. “Understanding human immune function using the resources from the Human Functional Genomics Project.” Nat. Med. 2016 Aug 4;22(8):831-3.
- [Preview] Jenna L. Pappalardo & David A. Hafler. “The Human Functional Genomics Project: Understanding Generation of Diversity” Cell. 2016 Nov 3;167(4):894-896.
- [論文] Yang Li et al. “A Functional Genomics Approach to Understand Variation in Cytokine Production in Humans.” Cell. 2016 Nov 3;167(4):1099-1110.e14.
- [論文] Rob ter Horst et al. “Host and Environmental Factors Influencing Individual Human Cytokine Responses” Cell. 2016 Nov 3;167(4):1111-1124.e13.
- [論文] Marije Oosting et al. “Functional and Genomic Architecture of Borrelia burgdorferi-Induced Cytokine Responses in Humans” Cell Host & Microbe Available online 3 November 2016,
- [論文] Raul Aguirre-Gamboa et al. “Differential Effects of Environmental and Genetic Factors on T and B Cell Immune Traits” Cell Reports Available online 3 November 2016.
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