CRISPR関連文献メモ_2016/01/28（論文２件；レビュー１件；技術ニュース１件） : crisp

（創薬等PF・構造生命科学ニュースウオッチ 2016/01/28）

[論文] Neisseria meningitidis 由来CRISPR/Cas9ゲノム編集ツールボックスの拡大：Gang Bao (Rice U.)
- N. meningitidis （Nme ）CRISPR/Cas9システムは、Streptococcus pyogenes (Spy ）CRISPR/Cas9システムよりも長いPAM（NNNNGATT）を認識し、Cas9はより小型である．
- HEK293T細胞において同一のプロトスペーサーを標的とするNme CRISPR/Cas9とSpy CRISPR/Cas9の比較、ならびに、Nme CRISPR/Cas9本来のcrRNA/tracrRNAとキメラsgRNAとの比較、を行った．
- Nme CRISPR/Cas9のオンターゲット切断活性はSpy CRISPR/Cas9と同程度以下であったが、ミスマッチが３塩基以下の範囲で、オフターゲット編集はゲノムワイドで低かった．
[レビュー] CRISPR技術によって、生細胞中に人工遺伝子回路を組み立てる：Timothy K. Lu (MIT)
- 合成生物学のゴールの一つである細胞を制御する人工遺伝子回路の構築には、配列に特異的でプログラム可能な転写因子（TFs）が必須である．CRISPR技術は、このTFs設計をこれまでになく容易にした．
- CRISPRによる人工遺伝子回路の構築法をレビューし、CRISPRを介した遺伝子制御の最新動向を論じる：
  - CRISPR/dCasによる転写制御システムを利用して、バクテリアおよび哺乳類細胞において、制御カスケードと論理ゲートが構築されている．
  - CRISPRを介した転写調節は、複数の遺伝子を同時に調整可能なレベルに達し、複雑な制御回路を構築する基盤が整った．
  - ガイドRNA（gRNAs）を改変することによって、転写調節可能なレベルを増やすことが可能になり、また、同一細胞においてある遺伝子群を活性化しその他の遺伝子群を抑制することが可能になっている．
  - 遺伝子回路の活性を誘導する手段が増えた：誘導可能なプロモーターによるgRNAの発現活性化；dCas9タンパク質の光による活性化．
[技術ニュース] 長鎖ノンコーディングRNA（lncRNAs）解明の新技術：Kelly Rae Chi (Science writer)
- 最近、細胞の多能性に関与するlincRNAsの遺伝子をCRISPR/Cas9で破壊することで、多能性ネットワークにおけるそれぞれのlincRNAの機能が明らかにされた（Jens Durruthy-Durruthy et al., 2016）．また、lncRNAの機能解析研究の先導者の一人John Rinnは、自ら開発したCRISPR-Display法（CRISPR-Disp）を使って、lncRNAsの機能解析に取り組んでいる．
  [注] CRISPR-Disp法の論文はこちら
- しかし、LncRNAsの阻害による機能推定は一筋縄ではいかない．LncRNAsの中には、タンパク質と同じDNAコードを持っているものがあることや、阻害による機能変化が起こらなかったとしても、そのlncRNAsが特定の条件下で機能を発揮することを否定するものではない．
- CRISPR技術の他に、lncRNAの局在を視覚化するRNA-FISH、RNAインタラクトームの測定技術、２次構造解析技術が取り上げられている．
[論文] ヒト胚に関わる研究倫理について中国と西側諸国に違いは存在しない：Reidar Lie (U. Bergen)
- 中山大学によるヒト胚ゲノム編集研究を契機として続いて来た中国に対する西側諸国の批判は不当である．
- 批判は、事実誤認に基づいており、また、国際的議論において中国を対等のパートナーとして認めようとする意思がないことを表出している．