1. [フォーラム] CRISPR/Cas9を介した精密ゲノム編集
[出典] Predicting CRISPR/Cas9-Induced Mutations for Precise Genome Editing. Molla KA, Yang Y. Trends Biotechnol. 2019-09-13.
- SpCas9はDSBに平滑末端を生成しエラープローンNHEJ過程を介してランダムで予測不可能な変異を残すとされてきたが、Cas9が付着末端を生成し、その修復結果を機械学習で予測可能とする研究成果をレビュー
- CRISPRメモ_2019/05/17-1 [第1項] SpCas9活性の深層学習モデルDeepCas9
- 2018-11-08 機械学習モデルにより一塩基編集技術を磨く (2件)：NHEJ/MMEJの道とHDRの道それぞれに
- CRISPRメモ_2018/08/11 [第1項] CRISPRゲノム編集の精度は標的サイトによって大きく変動する
2. [プロトコル] マウス着床前培養胚へのエレクトロポレーションを介して、CRISPR因子のin vivo活性を事前評価する
[出典] In Vivo Validation of CRISPR Reagents in Preimplantation Mouse Embryos. Larson MA, Gibson KA, Vivian JL. Methods Mol Biol. 2019-09-12.
- マウス胚におけるCRISPR-Cas9システムの活性を事前に予測することは困難なことから、必要な予備実験のプロトコル
3. [レビュー] CRISPRによる蛍光タンパク質ノックインの技術動向
[出典] Endogenous Fluorescence Tagging by CRISPR. Bukhari H, Müller T. Trends Cell Biol. 2019-09-12.
4. [レビュー] CRISPR/Cas9による中枢神経系へのウイルス感染と神経疾患の制御
[出典] A Broad Application of CRISPR Cas9 in Infectious Diseases of Central Nervous System. Bellizzi A, Ahye N, Jalagadugula G, Wollebo HS. J Neuroimmune Pharmacol. 2019-09-11.
- ウイルス各論 (HIV, JCV, HSV-1, HPV, HTLV-1, EBV, HCV, HBV); ウイルスのCRISPR/Cas9逃れ; CRISPR/Cas9送達法; 将来展望
5. 出芽酵母をモデルとするCRISPR遺伝子ドライブの設計と解析
[出典] Analysis of CRISPR gene drive design in budding yeast. Yan Y, Finnigan GC. Access Microbiology 2019-09-11.
- Gregory C. Finnigan (Kansas State University)グループはこれまでに[*]、遺伝子ドライブの種々の設計や制御機構を安全かつ短期間で検証可能とするS. cerevisiae CRSISPR/Cas9遺伝子ドライブ・システムを開発してきた。
- 今回は、標的アレルの欠失を伴うNHEJが遺伝子ドライブの過程で発生しないこと、２種類の外因性標的配列を利用して遺伝子ドライブの多重化が可能なことを確認し、遺伝子ドライブに耐性 (ヘテロ結合型遺伝子座)を帯びたクローンの発生機構について論じた。さらに、これまでのプラスミド由来のgRNAの発現をゲノム (遺伝子ドライブ遺伝子座)から発現に替えた第２世代遺伝子ドライブを開発しほぼ100%に近い成功率を達成した。
[*] Finnigan (Kansas State University)グループの成果関連crisp_bio記事
- CRISPRメモ_2017/09/24 [第3項] CRISPR/Cas9で出芽酵母ライブラリーをアップグレード
- CRISPRメモ_2018/12/21 [第2項] 酵母遺伝子ドライブの調節
- CRISPRメモ_2018/09/05-2 [第4項] S. cerevisiaeにおいてCas9の核原形質局在を介してCRISPR遺伝子ドライブの活性を調節
- CRISPRメモ_2018/08/16 [第2項] 出芽酵母の多重遺伝子座CRISPR遺伝子ドライブシステムを開発
- CRISPRメモ_2018/03/09 [第1項] SpCas9活性と遺伝子ドライブを抗-CRISPRタンパク質 (AcrIIA2; AcrIIA4)によって調節する：酵母での実証
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