出典"Leveraging genetic variants for personalized and allele-specific sgRNA design" Keough KC, Lyalina S, Olvera MP, Whalen S, Conklin BR, Pollard KS. bioRxiv 2018 June 8.概要ExcisionFinderで設計したsgRNAsは、個人ゲノムや集団に特有な遺伝子のホモ型変異とヘ …
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2018年06月
Cas4がCRISPRのadaptation過程 (免疫記憶生成過程) で担う機能詳らかに
出典[Preview] "Insights into a Mysterious CRISPR Adaptation Factor, Cas4" Hou Z, Zhang Y. Mol Cell 2018 Jun 7;70(5):757-758.；[論文] "Cas4 Nucleases Define the PAM, Length, and Orientation of DNA Fragments Integrated at CRISPR Loci" Shiimori M, Garrett SC …
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Base Editor (BE)による植物遺伝子編集拡がる
１．[News & Views]植物の遺伝子を１塩基ずつ編集する[出典] "Editing plant genes one base at a time" Shan Q, Voytas DF. Nat Plants 2018 June 4.二本鎖DNA (dsDNA)切断と修復テンプレートを必要としないBase Editors (BEs) (出典 Fig.1: Base editing 参照)による植物 …
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細胞増殖を調節する遺伝子の網羅的同定と組織特異性
[出典] "Profound Tissue Specificity in Proliferation Control Underlies Cancer Drivers and Aneuploidy Patterns" Sack LM, Davoli T, Li MZ, Li Y, Xu Q, Naxerova K, Wooten EC, Bernardi RJ, Martin TD, Chen T, Leng Y, Liang AC, Scorsone KA, Westbrook TF, Wong K …
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CRISPRメモ_2018/06/09 (Cascade/R-loop/Cas3の構造; スタートアップの新しい波; 倫理・規制の議論)
１．タイプI-E CRISPR Cascade-Casシステムによる二本鎖DNA切断の構造基盤[出典] "Structure basis for RNA-guided DNA degradation by Cascade and Cas3" Xiao Y, Luo M, Dolan AE, Liao M, Ke A. Science 2018 Jun 7.：EMデータ 7346(post-nicking state) 4.7Å; EMD-7347 …
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