1. 深層ニューラルネットワークモデルSeqCrisprを開発し、sgRNAの活性はsgRNAの配列に加えて標的遺伝子の遺伝子間相互作用のコンテクストにも依存することを同定[出典] "Identifying Context-specific Network Features for CRISPR-Cas9 Targeting Efficiency Using Accurate …
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2018年12月
CRISPRメモ_2018/12/24 (Perturb-seq；sgRNA設計ツール)
1. Perturb-seqのバージョンアップ[注] 本項紹介bioRxiv 投稿のNature Biotechnology誌査読付き論文版については、2020年4月6日付の以下のcrisp_bio記事を参照：2020-04-06 Perturb-seqバージョンアップ：スケーラブルかつマルチに. [出典] "Direct capture of CRISPR guid …
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CRISPRメモ_2018/12/13 (12件)
1. [レビュー] 癌の遺伝子治療を目的とするCRISPR/Cas9のデリバリー法[出典] REVIEW "Delivery systems of CRISPR/Cas9-based cancer gene therapy" Biagioni A et al (University of Florence). J Biol Eng. 2018-12-18. 目的に最適なデリバリー法を選択する決定木 (Fig. 1 …
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CRISPR-Cas9スクリーニングを使って、癌治療標的候補を仕分けする
[出典] "Prioritisation of oncology therapeutic targets using CRISPR-Cas9 screening" Behan FM, Iorio F [..] Yusa K, Garnett MJ. bioRxiv. 2018-12-20. Nature 2019-04-10. (crisp_bio: 本記事はbioRxiv 投稿版に準拠。NatureではタイトルがPrioritization of oncolog …
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髄膜炎菌から３拍子揃ったCas9 - コンパクト・ジニヌクレオチドPAM認識・高精度
[出典] "A Compact, High-Accuracy Cas9 with a Dinucleotide PAM for In Vivo Genome Editing" Edraki A, Mir A, Ibraheim R [..] Xue W, Rivera-Pérez, Sontheimer EJ (UMass Medical School). Mol Cell. 2018-12-20. 2019-02-21;73(4):714-726.e4.CRISPR-Casゲノム編集で …
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