crisp_bio

科学分野の比較的新しい論文と記事を記録しておくサイト: 主に、CRISPR生物学・技術開発・応用 (ゲノム編集, エピゲノム編集, 遺伝子治療, 分子診断/代謝工学, 合成生物学/進化, がん, 免疫, 老化, 育種 - 結果的に生物が関わる全分野) の観点から選択し、時折、タンパク質工学、情報資源・生物資源、新型コロナウイルスの起源・ワクチン・後遺症、機械学習・AIや研究公正からも選択

2020年04月

1. 機械学習により新たな抗-CRISPR (Acr)タンパク質を推定既知のAcrタンパク質の(アミノ酸)配列は極めて多様であり、in silico同定に利用可能なAcr配列の特徴が見えてこなかった。DoudnaグループとPakistan Institute of Engineering and Applied Sciencesの研究グループは今 …
続きを読む

1. [レビュー] CRISPR−Cas実験の基盤となるソフトウエア・ツール3種類のタイプ(編集-HDR/BE/PE; ノックアウト; 転写・エピゲノム制御)の実験全てに共通なgRNAの設計ツール (図1 標的可能なヒトゲノム部位; 表1と図2  E-CRISP, CRISPOR, GUIDES, CRISPick, RGEN Cas-Desi …
続きを読む

1. オトフェルリン遺伝子 (OTOF)変異難聴大型動物モデルを作出: エクソン5と6を標的とする2種類のsgRNAsとCas9 mRNA、または、RNP、にSTOPコドンを帯びたssODNを組み合わせたHDRによって実現; 仔羊73匹を得、13匹がindelsを帯び、その内8匹 (61.5%)にノックイン変異を同定; …
続きを読む