1. 機械学習により新たな抗-CRISPR (Acr)タンパク質を推定既知のAcrタンパク質の(アミノ酸)配列は極めて多様であり、in silico同定に利用可能なAcr配列の特徴が見えてこなかった。DoudnaグループとPakistan Institute of Engineering and Applied Sciencesの研究グループは今 …
続きを読む
2020年04月
CRISPRメモ_2020/04/16 - 2 (技術基盤と開発)
1. [レビュー] CRISPR−Cas実験の基盤となるソフトウエア・ツール3種類のタイプ(編集-HDR/BE/PE; ノックアウト; 転写・エピゲノム制御)の実験全てに共通なgRNAの設計ツール (図1 標的可能なヒトゲノム部位; 表1と図2 E-CRISP, CRISPOR, GUIDES, CRISPick, RGEN Cas-Desi …
続きを読む
CRISPRメモ_2020/04/15 (7件)
1. オトフェルリン遺伝子 (OTOF)変異難聴大型動物モデルを作出: エクソン5と6を標的とする2種類のsgRNAsとCas9 mRNA、または、RNP、にSTOPコドンを帯びたssODNを組み合わせたHDRによって実現; 仔羊73匹を得、13匹がindelsを帯び、その内8匹 (61.5%)にノックイン変異を同定; …
続きを読む
加齢あるいは遺伝子変異に因るミクログリア内での脂肪滴蓄積を発見し、その神経変性疾患との相関を示唆
[出典] "Lipid-droplet-accumulating microglia represent a dysfunctional and proinflammatory state in the aging brain" Marschallinger J [..] Wyss-Coray T. Nat Neurosci 202001-31 (bioRxiv 2019-08-06). ミクログリアは加齢と共に徐々に活性化する一方で形態 …
続きを読む
Cas13d/CasRxにより神経細胞消失を修復: 成体マウスin vivoでグリア細胞を神経細胞へと転換
[出典] "Glia-to-Neuron Conversion by CRISPR-CasRx Alleviates Symptoms of Neurological Disease in Mice" Zhou H, Su J, Hu X, Zhou C [..] Yang H. Cell 2020-04-08. 中国科学院上海生命科学研究院の神経科学と計算生物学の研究グループは今回、CRISPR-Cas遺伝子 …
続きを読む