[出典] "crisprSQL: a novel database platform for CRISPR/Cas off-target cleavage assays" Störtz F, Minary P. (U Oxford). Nucleic Acids Res. 2020-10-21. crisprSQL (version 10 July 2020)の概要 [Figure 1引用右図参照]154のガイドRNAと25,632の標的配列を登録 …
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2020年10月
新型コロナウイルスのPDB新規公開構造 (2020-10-28)
同一論文・投稿 (to be publishedを含む)ごとのリストのため、新規公開エントリーより以前に公開されたエントリーも含まれている。カラムTitleは、To be publishedの投稿については仮置であり、ジャーナルからの公開時には変更されている可能性がある。 カラムRelease Date …
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Cas12aがDNA切断活性を発揮する機構を、全原子分子動力学シミュレーションで探った
[出典] "Molecular Dynamics Reveals a DNA-Induced Dynamic Switch Triggering Activation of CRISPR-Cas12a" Saha A, Arantes PR [..] Palermo G. J Chem Inf Model. 2020-10-27. CRISPR-Cas12aのコラテラル活性をベースとした超高感度核酸検出システムDETECTRは、SARS- …
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CRISPR-CBEI: CBEによるストップコドン生成を介した遺伝子不活性化用のsgRNAs設計支援ツール
[出典] "CRISPR-CBEI: a Designing and Analyzing Tool Kit for Cytosine Base Editor-Mediated Gene Inactivation" Yu H, Wu Z, Chen X, Ji Q, Tao S. mSystems 2020-09-22. [注] CBEI (cytosine base editor-mediated gene inactivation) 西北農林科技大学と上海科技大 …
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CEN-tools: 大規模なゲノムワイドCRISPRスクリーンのデータをベースとして, コンテクストに依存する必須遺伝子と細胞過程の同定を支援する情報資源
[出典] "CEN‐tools: an integrative platform to identify the contexts of essential genes" Sharma S, Dincer C, Weidemüller P, Wright GJ, Petsalaki E. Mol Syst Biol. 2020-10-19. EMBLとWellcome Sanger Instituteの研究チームが今回、Context‐specific Essenti …
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