1. 第2回ヒトゲノム編集国際サミットから1年、Jennifer Doudnaの思い
[出典] CRISPR's unwanted anniversary. Doudna J. Science. 2019-11-15.
CRISPRbabies [*] の事案以来のモラトリウムの議論は終え、緊急に然るべき規制 (regulation)を定めるべき
[*] 関連crisp_bio記事
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- CRISPRメモ_2019/10/19 [第4項] [インタビュー記事] ロシアの研究者、難聴 (deaf)遺伝子編集をの女性の卵子のゲノム編集を開始
- 2019-08-02 'CRISPRbabies'に至るまでと'CRISPRbabies'のこれから)
2. ロングリードシーケンシングによりサンガーシーケンシングでは困難な、CRISPR/Cas9 HDRによるマウス胚ゲノム編集由来モザイク・ファウンダーにおける編集結果の的確な判定を実現
[出典] Application of long-read sequencing for robust identification of correct alleles in genome edited animal. McCabe CV, Codner GF [..] Sanderson ND, Teboul L. bioRxiv. 2019-11-14.
MRC Harwell InstituteとUniversity of Oxfordの研究グループは今回、CRISPR/Cas9とロング・シングル・ストランドDNA (lssDNA)ドナーを介したマウス一細胞胚編集がもたらすモザイク・ファウンダーとその仔における目的とした変異の同定が、サンガーシーケンシングでは困難であったところ、Oxford Nanopore Technologies技術によるシーケンシング (ONTシーケンシング)により実現した。
3. 一部のウイルスが帯びているmini-CRISPRアレイは、ウイルス間の競合に寄与する
[出典] Virus-borne mini-CRISPR arrays are involved in interviral conflicts. Medvedeva S [..] Krupovic M. Nat Commun. 2019-11-15.
Institut Pasteur、Skolkovo Institute of Science and Technology (ロシア)およびNCBIなどの研究グループが、超好熱性のスルフォロブス目アーケアのCRISPRome (マイクロバイオームに存在する全てのスペーサ)のディープ・シーケンシングにより、もっとも多いスペーサの一部が、アーケア・ウイルスが帯びているCRISPRアレイに由来することを同定し、それにより、アーケアがウイルスの重感染を排除し、一方で、アーケア・ウイルスが種分化するとした (下図は、Fig. 6から引用した「ウイルスのmini-CRISPRに由来するcrRNAが、宿主アーケアが帯びているCRISPR-Casの干渉モジュール (i-Cas)に融合することで、近縁ウイルスの感染を防御する機序のモデル図」)


4. ケージドgRNAを利用して、HEK93T細胞とゼブラフィッシュ胚においてCRISPR/Cas9の精密な時空間制御を実現
[出典] Spatiotemporal Control of CRISPR/Cas9 Function in Cells and Zebrafish using Light-Activated Guide RNA. Zhou W [..] Deiters A. bioRxiv. 2019-11-13. > Angew Chem Int Ed Engl 2020-03-11.
University of PittsburghとHorizon Discoveryの研究グループが、gRNAのウリジンおよびグアノシンに 6-Nitropiperonyloxymethyl (NPOM)を結合することで (ケージド核酸塩基とすることで)、表題を実現した。
5. [レビュー] lncRNAの一種DNACR (Differentiation antagonizing non-protein coding RNA)は、ヒト癌の治療標的である
[出典] [REVIEW] Long Non-coding RNA DANCR as an Emerging Therapeutic Target in Human Cancers. Jin SJ, Jin MZ, Xiao BR, Jin WL. Front Oncol. 2019-11-15.
上海交通大学とハルビン医科大学の研究グループが、ヒト癌におけるDNACRの機能と分子機構、および、DNACRを標的とするCRISPR/Cas9、アンチセンスオリゴヌクレオチドおよびsiRNAによる療法、および、発癌性lncRNA療法に利用されるベクター (ウイルス、脂質またはエクソソーム)をレビューした (下図は、FIGURE2を引用した種々の癌におけるDANCRの分子機構の模式図)。

[CRISPRによるlncRNAs解析関連crisp_bio記事]

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- CRISPRメモ_2019/11/11-1 [第1項] CASPR: lncRNAのCRISPRスクリーンに利用するガイドRNA設計パイプライン
- CRISPRメモ_2019/08/08 [第2項] [レビュー] RNA調節を系統的に研究するためのCRISPRツール
- CRISPRメモ_2019/07/07 [第2項] 癌細胞で発現し保存性が極めて高いlncRNAsを同定した上で、CRISPR/Cas9とsgRNAsのペアにより保存されているドメインを削除する機能スクリーンニングにより、発癌性を帯びたlncRNAsを特定
- CRISPRメモ_2019/03/02 [第5項] [レビュー] CRISPR-Cas9スクリーニングによる癌療法の標的となりえるlncRNAs'onco-lncRNAa'のプロファイリング
- CRISPRメモ_2019/02/25 [第2項] Xistのサイレンシング・ドメインを、タイリングCRISPRで同定
- 2019-01/10 RNA-タンパク質相互作用の網羅的解析を任意の生物について可能にする手法の開発と実証
- CRISPRメモ_2018/11/06 [第1項] スプライス部位を標的とするゲノムワイドCRISPRスクリーンで ヒト細胞必須lncRNAs同定
- CRISPRメモ_2018/10/06 [第1項] [データベース] CRISPRlnc: lncRNAsを標的とするsgRNAsのデータベースをマニュアルでの品質管理のもとに構築
- CRISPRメモ_2018/08/04 [第2項] 線虫を対象として、長鎖ノンコーディングRNAs (lncRNAs)の機能アノテーションを実現
- CRISPRメモ_20180420 [第3項] 癌の化学療法に対する薬剤耐性に関与するlncRNAsのin silico同定と機能解析
- CRISPR関連文献メモ_2016/11/08 [第1項] CRISPR/Cas9によるヒトlncRNAのゲノムスケール機能喪失スクリーニングを実現
- CRISPR関連文献メモ_2016/02/13 [第2項] CRISPRiによるショウジョウバエlncRNAsの効率的ノックダウン
- CRISPR関連文献メモ_2016/01/28 [第3項] 長鎖ノンコーディングRNA(lncRNAs)解明の新技術
- CRISPR関連文献メモ_2016/10/05 [第4項] 長鎖ノンコーディングRNA(lncRNAs)遺伝子の編集
- 創薬等PF・構造生命科学ニュースウオッチ 2016/10/27 大腸癌発症に関与する長鎖ノンコーディングRNAs(lncRNAs)
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