1. インターロイキン IL-1αに応答する2種類のエンハンサーが協働してクロマチンのトポロジーを迅速かつ広範囲に改変する
[出典] Distinct IL-1a-responsive enhancers promote acute and coordinated changes in chromatin topology in a hierarchical manner. Weiterer SS, Meier-Soelch J, Georgomanolis T [..] Papantonis A, Kracht M. EMBO J. 2020-01-02. Online 2019-11-07
 Justus Liebig University Giessen、University of Cologne、University Medical Center Göttingenなどの研究グループは、インターロイキン IL-1αが、炎症性疾患に関連するSNPsが密集している領域において、TAK1とNF-κBを介して、クロマチンアクセシビリティを迅速かつ広い範囲で改変するエンハンサー間の階層的相互作用に基づく機序を、ATAC-seq、架橋不要なi4C-seq (Mol Syst Biol, 2016)、smRNA FISHおよびCRISPRゲノム編集技術 (60-nt未満の微小な領域の削除とCRSIPRa)により明らかにした。

[エンハンサー機能解析参考記事] 2019-09-10 エンハンサー機能解析ツールenCRISPRaとenCRISPRi

2. Cas4を伴わないE. coliのタイプI-E CRISPRにおける外来DNAからの断片のスペーサへの加工は内在3'-5'エクソヌクレアーゼDnaQまたはExoTに依存する。
[出典] Processing and integration of functionally oriented prespacers in the E. coli CRISPR system depends on bacterial host exonucleases. Ramachandran A, Summerville L, Learn BA,  DeBell L, Bailey S. J Biol Chem. 2019-12-30.  
 タイプI CRISPR-Casシステムでは、Cas1-Cas2複合体が外来DNAから断片 (prespacers)を獲得しCas4がprespacersの末端を処理しPAMを切り離す機構が知られているが、Cas4が存在しない場合もある。Johns Hopkins Bloomberg School of Public HealthとJohns Hopkins Universityの研究グループは今回、大腸菌において表題の結論に達した。

3. CRISPR/Cas9によるJurkat T細胞への単純かつ効率的ノックイン
[出典] A simple and efficient workflow for generation of knock-in mutations in Jurkat T cells using CRISPR/Cas9. Borowicz P, Chan H [..] Spurkland A. Scand J Immunol. 2019-12-30
 University of Osloの研究グループは、恒常的に発現しているLCK遺伝子座とT細胞活性化による発現が誘導されるSH2D2A遺伝子座へssDNAを修復テンプレートとするCRISPR/Cas9誘導HDRを介して、1アミノ酸変異導入を実現した。また、設計通りのノックインが発生したクローンのスクリーニング法を確立した (ワークフローの全体像について、Figure 1引用下図参照)Jurkat T cells
4. BE4によるマウスのチロシナーゼへの未成熟ストップコドン誘導を、オフターゲットを伴わず56.24%の効率で達成
[出典] Efficient Single Base Editing in Mouse Using Cytosine Base Editor 4. Adlat S [..] Zhang L, Zheng Y, Feng X. Preprint. 2019-12-30 (Not Peer-reviewed). 
 東北師範大学とUCSFなどの共同研究グループの報告

5. 学士課程半期を想定したCRISPR/Cas9によるC. elegans遺伝子への蛍光タンパク質ノックイン実験コース
#カリキュラム 
[出典] A Scalable CURE Using a CRISPR/Case Fluorescent Protein Knock-In Strategy in Caenorhabditis elegans. Hastie E, Sellers R, Valan B, Sherwood DR. J Microbiol Biol Educ. 2019-12-18
 論文表題のCUREはCourse-based Undergraduate Research Experiencesを意味する。Duke Universityの研究グループが、C. elegansのマトリックスメタロプロテアーゼ遺伝子zmp-4を標的とするノックイン実験のCURE向けコース を設計した。CRISPR技術をテーマとするCUREコースは、これまで、バクテリア、酵母、ゼブラフィッシュ およびC. elegansを対象としたコースが実施されているが、今回、Cas9-sgRNAのプラスミドとHDR用修復テンプレートの2プラスミドの作製から、線虫へのインジェクションを経て、顕微鏡によるzmp-4の局在同定までのコースを設計した。

6. 学部学生とアドバンスト・プレイスメント (APプログラム)に向けたCRISPR技術による酵母ゲノム編集実験
#カリキュラム 
[出典] An Introduction to CRISPR-Mediated Genome Editing in Fungi. Vyas VK, Bernstein DA. J Microbiol Biol Educ. 2019-12-18
 Whitehead Institute for Biomedical ResearchとBall State Universityの研究チームが、遺伝型の変化が表現型の変化をもたらすことの理解と最先端技術に触れる機会をもたらす表題実験を設計した:Cas9, gRNAおよび修復テンプレートの全てをコードしたベクターを利用して、酵母のADE2遺伝子に未成熟ストップコドンを誘導することで生じる酵母コロニーの色の変化を観察する。