crisp_bio

科学分野の比較的新しい論文と記事を記録しておくサイト: 主に、CRISPR生物学・技術開発・応用 (ゲノム編集, エピゲノム編集, 遺伝子治療, 分子診断/代謝工学, 合成生物学/進化, がん, 免疫, 老化, 育種 - 結果的に生物が関わる全分野) の観点から選択し、時折、タンパク質工学、情報資源・生物資源、新型コロナウイルスの起源・ワクチン・後遺症、機械学習・AIや研究公正からも選択

[出典] An isothermal method for sensitive detection of Mycobacterium tuberculosis complexes using CRISPR/Cas12a cis- and trans-cleavage. Xu H [..] Liu X, Liu J. bioRxiv 2020-02-04.

 福建医科大学を主とする研究グループがDETECTR [*]に準拠したシステムで結核菌群の高感度検出を実現した。
  • 精製したLbCas12aタンパク質と結核菌群の保存性の高い配列を標的とするgRNAを利用し、検出限界 (LOD) 4.48 fM、結核菌の濃度と蛍光強度の相関の決定係数 0.9775を実現した。
  • 喀痰由来の193サンプルを対象として、培養株のゲノム解析の結果と照合した結果、感度と特異度は、それぞれ99.29% (139/140)と100% (53/53)に達した (信頼区間99%)。
 [*] DETECTRの模式図とSHERLOCKの模式図と共に、Addgeneの関連ブログの図を編集して下図に表示DETECTR 6 SHERLOCK
[Cas12a関連crisp_bio記事] crisp_bio: CRISPR-Cas12コレクション [2020-02-05改訂]
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