[出典] "SpCas9-NG self-targets the sgRNA sequence in plant genome editing" Qin R, Li J [..] Yan J, Wei P. Nat Plants 2020-02-24
  • SpCas9-NG [*] はPAM配列としてNGNを認識し、Cas9の標的可能範囲が大きく広げることになったSpCas9の変異型である。
  • 安徽省農業科学院水稻研究所の研究グループは今回、SpCas9-NGを、アグロバクテリウムのプラスミドにおけるT-DNAを利用して遺伝子導入するアグロバクテリウム法を介して利用する場合、SpCas9-NGイネゲノムと共に、T-DNA内のsgRNAに変異が誘導され、その"変異型sgRNAs"によるオフターゲット編集が発生することを、イネで、示した。
  • 同時にこの問題を、GTTTTで始まるsgRNAスキャフォールドを、GTTTCから始まるように改変することで、回避可能なことも示した。
  • SpCas9-NGの他に、SpCas9-NGに由来するbase editors (BE3, CDA1, ABE)でも検証
[引用記事と関連論文]
  • [*] crisp_bio 2018-08-31 SpCas9-NG:SpCas9の標的範囲をさらに広げる合理的な変異導入
  • "Cas9-NG greatly expands the targeting scope of the genome-editing toolkit by recognizing NG and other atypical PAMs in rice" Ren B, Liu L [..] Lin H, Zhou H. Mol Plant 2019-07-01
  • " Improving plant genome editing with high-fidelity xCas9 and non-canonical PAM-targeting Cas9-NG" Zhong Z, Sretenovic S [..] Qi Y, Zhang Y. Mol Plant 2019-07-01