[出典] "Small molecule regulated sgRNAs enable control of genome editing in E. coli by Cas9" Iwasaki RS, [..] Batey RT. Nat Commun 2020-03-13
- CRISPRシステムによるE. coliのゲノム編集が報告されてきたが、バクテリアにおけるdsNDA切断の致死性などのため形質転換効率が低いという課題を伴っていた。
- University of Colorado at Boulderの研究グループは今回、先行研究のCREATE (CRISPR-enabled trackable genome engineering) [*]を利用して、theophyllineまたは3-methylxanthine (3MX)によって、Cas9の活性をスイッチ可能とするアプタマー包含sgRNAs (switchable aptomer-egRNAs)を同定する系を開発した。 [Fig. 1 引用下図参照]
- それぞれの低分子を添加するタイミングと用量によるE. coliゲノム編集の制御、および、２種類の低分子を順次添加することでの多重遺伝子編集も実現した。
[*] CREATE論文と関連crisp_bio記事
- “Genome-wide mapping of mutations at single-nucleotide resolution for protein, metabolic and genome engineering” Garst AD [..] Gill RT. Nat. Biotechnol 2016-12-12.
- CRISPR関連文献メモ_2016/12/18 #6 ゲノム全域にわたる一塩基分解能の変異マップ作成を可能にするCREATE法
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