crisp_bio

科学分野の比較的新しい論文と記事を記録しておくサイト: 主に、CRISPR生物学・技術開発・応用 (ゲノム編集, エピゲノム編集, 遺伝子治療, 分子診断/代謝工学, 合成生物学/進化, がん, 免疫, 老化, 育種 - 結果的に生物が関わる全分野) の観点から選択し、時折、タンパク質工学、情報資源・生物資源、新型コロナウイルスの起源・ワクチン・後遺症、機械学習・AIや研究公正からも選択

[出典] "CGD: Comprehensive Guide Designer for CRISPR-Cas Systems" Menon AV, Sohn J, Nam JW. Comput Struct Biotechnol J 2020-03-25.

 漢陽大学校の研究チームが、多様なCRISPR-CasシステムのsgRNAsの設計を支援する表題のCGDを開発し、ソースコードとデータセット、および、サービスサイトを公開した:
 研究チームは、機械学習アルゴリズムENLR (Elastic Net Logistic Regression/エラスティックネット・ロジスティック回帰)を、CRISPRi, CRISPRa, CRISPR-Cas9, およびCRISPR-Cas12aによる実験に由来する公開データにて学習させたモデルCGDi, CGDa, CGD9, およびCGD12aを構築し、ENLRモデルは、他の回帰モデルに基づく既存モデルに優ることを示した。
このエントリーをはてなブックマークに追加

コメント

コメントフォーム
評価する
  • 1
  • 2
  • 3
  • 4
  • 5
  • リセット
  • 1
  • 2
  • 3
  • 4
  • 5
  • リセット