CRISPRメモ_2020-04-07 - 1 (応用11件) : crisp

1. IDEA (Induction Dynamics gene Expression Atlas): 単一転写因子誘導実験の重ね併せから遺伝子発現アトラスを構築・公開

[出典] "Learning causal networks using inducible transcription factors and transcriptome‐wide time series" Hackett SR [..] McIsaac RS. Mol Syst Biol 2020-03-17 ; IDEA提供Webサイトはコチラ

2. CREPE: erro-prone PCRによる変異配列ライブラリー生成とCas9とλ-redによるリコンビニアリングを介して、E. coli非必須／必須遺伝子を対象とするディープ変異スキャニングを実現

[出典] "CRISPR/Cas9 recombineering‐mediated deep mutational scanning of essential genes in Escherichia coli" Choudhury A, Fenster JA, Fankhauser RG, Kaar JL, Tenaillon O, Gill RT. Mol Syst Biol 2020-03-16; CREPEは"CRISPR/Cas9-mediated genomic error-prone edting"に由来する。

3. CiBER-seq: 定量的CRISPRiによる機能ゲノミクス

[出典] "CiBER-seq dissects genetic networks by quantitative CRISPRi profiling of expression phenotypes" Muller R, Meacham ZA, Ferguson L, Ingolia NT. bioRxiv 2020-03-31; CiBER-seqはCRISPR interference with barcoded expression reporter sequencingに由来する

4. SaCas9によるラット脳の機能ゲノミクス

[出典] "Development of a CRISPR-SaCas9 system for projection- and function-specific gene editing in the rat brain" Sun H [..] Yi M, Wan Y. Sci Adv 2020-03-18.

5. 牛眼症などの遺伝子疾患ゼブラフィッシュモデル作出

[出典] "Precise short sequence insertion in zebrafish using a CRISPR/Cas9 approach to generate a constitutively soluble Lrp2 protein" Collery RF, Link BA. Front Cell Dev Biol. Accepted 2019-07-31.

6. CRISPR/Cas9 KOマウスでの実験から、Oospファミリーの一連の遺伝子がマウス雌の受胎に必須ではないことが判明

[出典] "CRISPR/Cas9-Mediated Genome Editing Reveals Oosp Family Genes are Dispensable for Female Fertility in Mice" Abbasi F, 小谷まよ [..] 伊川正人. Cells 2020-03-28.

7. ヒト肺移植への応用を目的として、ラット肺においてCRISPRaにより免疫応答を抑制する内在IL-10遺伝子の活性化を実証

[出典] "CRISPR/Cas9-Based Transcriptional Activation of Endogenous IL-10 Gene in the Donor Lung for Transplantation" Mesaki K [..] Keshavjee S. J Heart Lung Transpl 2020-03-30.

8. 網膜芽細胞腫の研究資源として、CRISPR/Cas9を利用してH9 hESCsにおいてRB1プロモーターの単一アレルまたは両アレルを欠損させた細胞株を樹立

[出典] "Biallelic and monoallelic deletion of the RB1 promoter in six isogenic clonal H9 hESC lines" Döpper H[..] Steenpass L. Stem Cell Res 2020-03-11.

9. CCR5-Δ32/Δ32の生物学的意味を理論的に検証し、CRISPR/Cas9による生殖細胞系列のゲノム編集のあり方について考察

[出典] "CCR5-Δ32 biology, gene editing, and warnings for the future of CRISPR-Cas9 as a human and humane gene editing tool" Xu MM. Cell & Bioscience 2020-03-30.

10. CRISPRホーミングに基づく#遺伝子ドライブに対する耐性を回避するgRNAsの多重化は２〜８重の範囲が適切

[出典] "Computational and experimental performance of CRISPR homing gene drive strategies with multiplexed gRNAs" Champer SE [..] Champer J. Sci Adv 2020-03-04.