2020-11-10 更新 第2項のATR阻害剤耐性に関するゲノムワイドスクリーングに関するbioRxiv投稿2件のPLoS geneticsNucleic Acids Res. 2020-07-27.刊行論文へのリンクを追加
2020-04-16 初稿

1. 子宮頸がんCRISPR療法
 ヒトパピローマウイルスのE6タンパク質とE7タンパク質による子宮頸がんモデルマウスに、各遺伝子を標的とするCas9-sgRNAを、PEGで修飾したリポソームで送達することで、細胞死を介して腫瘍細胞が消失することを実証
[出典] "Systemic Delivery of CRISPR/Cas9 Targeting HPV Oncogenes Is Effective at Eliminating Established Tumors" Jubair L, Fallaha S, McMillan NAJ (Griffith University). Mol Ther 2019-08-29.

2. G. L. Moldovan (Pennsylvania State University College of Medicine)のグループからのCRISPRスクリーニングによる癌の薬剤耐性機構と合成致死性の機構に関するbioRxiv投稿2件

(1) 2種類のATR阻害剤 (ATRi: VE822; AZD6738
)に対する癌細胞の耐性に関与する遺伝子群を、CRISPR KOとCRISPRaの二重のゲノムワイドスクリーンで探った
 HeLa細胞のCRISPR KOスクリーンでそのノックアウトがATRi耐性をもたらすパスウエイ(遺伝子群)を同定し、トップヒット500件中155件、40件中7件が、2種類のATRi間に共通していることを見出した。
 HeLa細胞のCRISPRaスクリーンではその過剰発現がATRi耐性をもたらすパスウエイ/遺伝子群を同定し、CRISPR KOと同様に、2種類のATRi間に共通性を見出した。CRISPRaスクリーンは正常細胞 (乳腺上皮細胞MCF10A)に対しても行い、CRISPR KOの結果と同様に2種類のATRi間に共通性を見出したが、細胞株間に共通するヒットは殆どなかった。
[出典] "Dual genome-wide CRISPR knockout and CRISPR activation screens identify common mechanisms that regulate the resistance to multiple ATR inhibitors" Schleicher EM [..] Moldovan GL (Pennsylvania State University College of Medicine). bioRxiv 2020-04-09. > PLoS genetics.  2020-11-02.

(2) PARP14欠失細胞を対象とするゲノムワイドCRISPR KOスクリーンにより、ATR-CHK1パスウエイが、PARP14欠失細胞の生存に必須と同定し、複製フォークの安定性が、合成致死性に関与することを見出した
[出典] "Genome-wide CRISPR synthetic lethality screen identifies a role for the ADP-ribosyltransferase PARP14 in replication fork stability controlled by ATR" Dhoonmoon A, Schleicher EM [..] Moldovan GL. bioRxiv 2020-04-09 > Nucleic Acids Res. 2020-07-27.

3. C4型光合成経路研究のモデル植物になってきたエノコログサの高効率なゲノム編集
 プロトプラストでのアッセイ法を開発して多重化CRISPR/Cas9システムを最適化し、さらに、DSB末端からのDNA鎖を削り込むTrex2エクソヌクレアーゼを加えることで実現した。
 誘導変異の94%が>10 bpの領域が削除であり、その52.2%がMMEJ修復を経由 (Cas9の場合は3.5%)であり、svDrm1asvDrm1bの2遺伝子の同時編集効率T0世代で73-100%、T1世代への継承率60%、その33%が両アレル変異/ホモ型変異であった。 
[出典] "Optimization of multiplexed CRISPR/Cas9 system for highly efficient genome editing in Setaria viridis" Weiss T [..] Zhang F (U. Minnesota). bioRxiv 2020-04-12