2022-05-12 Methods in Molecular Biologyシリーズ掲載プロトコル論文の書誌情報とアブストラクトを追記し，ブログ記事タイトルを"酵母の~1,500必須遺伝子上の17,000サイトを, 塩基エディターTarget-AIDにより同時並行編集"から"塩基エディテングを利用して, 酵母必須遺伝子上の17,000サイトを標的とする変異誘発スクリーニングを実現"に改訂
[出典] “High-Throughput Gene Mutagenesis Screening Using Base Editing” Després PC, Dubé AK, Yachie N, Landry CR. In: Devaux F. (eds) Yeast Functional Genomics. MIMB 2022-05-01. https://doi.org/10.1007/978-1-0716-2257-5_19 [著者所属] U Laval, U British Columbia, U Tokyo, Keio U.
　酵母を対象とする塩基エディターTarget-AIDを介した大規模塩基編集スクリーニングでは，数千の部位を同時に変異させることが可能である．変異が酵母細胞のフィットネスに及ぼす影響は，プール型増殖競合アッセイと，バーコードの役割も担っているgRNAのDNAシーケンシングにより測定する．
2020-04-25 初稿
 [出典] "Perturbing proteomes at single residue resolution using base editing" Després PC [..]  Yachie N, Landry CR. Nat Commun 2020-04-20. 

　Université Lavalと東大の研究グループは今回、Target-AID*による１塩基分解能での198531e1スクリーンを試み、酵母細胞のフィットネスに影響を及ぼす605遺伝子座にわたる708種類のgRNAsを(すなわち、遺伝子上の標的塩基)を同定した (手法についてFig. 2引用右図参照)。
　続いて、フィットネスに顕著な影響を誘導するgRNAsが、アミノ酸残基の保存性やタンパク質の安定性に影響を与えるアミノ酸変異に集中していたことから、鍵となるアミノ酸をゲノムワイドで同定するに塩基エディターが有用であるとした。

　また、得られた実験データからTarget-AIDの効率に影響を及ぼす因子ならびに変異誘発に影響を及ぼすgRNAsと標的の特徴を同定し、実験目的に応じて最適化可能なことを示した。

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