crisp_bio

科学分野の比較的新しい論文と記事を記録しておくサイト: 主に、CRISPR生物学・技術開発・応用 (ゲノム編集, エピゲノム編集, 遺伝子治療, 分子診断/代謝工学, 合成生物学/進化, がん, 免疫, 老化, 育種 - 結果的に生物が関わる全分野) の観点から選択し、時折、タンパク質工学、情報資源・生物資源、新型コロナウイルスの起源・ワクチン・後遺症、機械学習・AIや研究公正からも選択

1. 真核生物RNA-seq用に開発したDASH (*)を微生物におけるrRNAsの排除へと展開し、微生物における効率的RNA-seqを実現
[出典] "Improved bacterial RNA-seq by Cas9-based depletion of ribosomal RNA reads" Prezza G, Heckel T, Dietrich S, Homberger C, Westermann AJ, Vogel J. RNA 2020-04-28; (*) DASH (Depletion of Abundant Sequences by Hybridization): crisp_bio 2017-04-18 Cas9を利用して、シーケンシングの対象とするライブラリーを絞り込む - 

2. CRISPR/Cas9システムでWxのプロモーターを編集することで、アミローズレベルの微調整と穀粒品質向上を実現
[出典] "Creating Novel Wx Alleles with Fine-tuned Amylose Levels and Improved Grain Quality in Rice by Promoter Editing using CRISPR/Cas9 System" Huang L, Li Q, Zhang C [..] Liu Q (揚州大学) . Plant Biotechnol J 2020-04-27

3. CRISPR/Cas9技術により尿酸オキシダーゼ 欠損ラットを作出
  • 昆明医科大学と雲南中医薬大学の研究グループが、マウスでは致死性のため不可能であった尿酸オキシダーゼ遺伝子 (Uox)を欠損し、ヒトの高尿酸血症の症状を再現し、それ以外は、正常なモデル動物をラットで樹立し、“Kunming-DY rats”と命名した。
[出典] "Uricase-deficient rat is generated with CRISPR/Cas9 technique" Yu Y, Zhang N, Dong X, Fan N, Wang L, Xu Y, Chen H, Duan W. PeerJ 2020-04-27

4. [レビュー] 遺伝性網膜ジストロフィーの変異解析とモデリングのためのCRISPRツール
  • Instituto de Investigación Sanitaria La Feなどスペインの研究グループが、250種類を超える変異およびこれから同定される変異の機能解析およびそれらの変異を帯びたモデル動物作出に有用なCRISPRツールの最新動向と課題をレビュー
[出典] "Application of CRISPR Tools for Variant Interpretation and Disease Modeling in Inherited Retinal Dystrophies" Fuster-García C [..] García-García G. Genes 2020-04-27

5. 群馬大グループ、floxマウス作出法としてloxPペアをCRISPR/Cas9により1細胞期と2細胞期に順次エレクトロポレーションする手法の弱点を解消
  • 先行研究の手法 (**)は、2細胞期のエレクトロポレーションの際に、割球融合が高頻度で発生し、4倍体胚が生成され、生存胎子を得るに至らないという課題を伴っていた。
  • 研究グループは今回、カルシウム・フリー処理とサイトカラシン処理を介したアクチン重合阻害により、割球融合抑止を実現した。
  • (**) CRISPRメモ_2017/08/15 #1.Floxマウスの効率的作出
[出典] "Calcium-Free and Cytochalasin B Treatment Inhibits Blastomere Fusion in 2-Cell Stage Embryos for the Generation of Floxed Mice via Sequential Electroporation" Horii T [..] Hatada I. Cells 2020-04-28 

6. [展望] CRISPR/Cas9を光で操作する: 紫外光から近赤外光へ 
[出典] "Optical manipulation of CRISRP/Cas9 functions: From ultraviolet to near-infrared light" Chen Y, Yan X, Ping Y. ACS Material Lett. 2020-04-28
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