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科学分野の比較的新しい論文と記事を記録しておくサイト: 主に、CRISPR生物学・技術開発・応用 (ゲノム編集, エピゲノム編集, 遺伝子治療, 分子診断/代謝工学, 合成生物学/進化, がん, 免疫, 老化, 育種 - 結果的に生物が関わる全分野) の観点から選択し、時折、タンパク質工学、情報資源・生物資源、新型コロナウイルスの起源・ワクチン・後遺症、機械学習・AIや研究公正からも選択

1. CBEを介したiSTOPと、CRISPR/Cas9を介したフレームシフトによる1遺伝子および隣り合う2遺伝子ノックアウトをHEK293Tにて比較し、前者の方がコントローラブルと結論
[出典] "Comparison of gene disruption induced by cytosine base editing-mediated iSTOP with CRISPR/Cas9-mediated frameshift" Dang L [..] Cui S, Huang X. Cell Prolif 2020-04-29

2. 3種類の染色体上に位置するカルモジュリン遺伝子 (CALM1/2/3)の発現をCRISPR/Cas9とTet-Offシステムで制御する系を樹立することで、HeLa細胞においてカルモジュリンが細胞周期に及ぼす作用解析を実現
[出典] REVIEW "The impact of calmodulin on the cell cycle analyzed in a novel human cellular genetic system" Munk ZM [..] Berchtold MW, Panina S. Cell Calcium 2020-04-30

3. アメリカンクォーターホースに見られる有害突然変異*の修復を、皮膚細胞由来初代線維芽細胞において、CRISPR-Cas9 HDRを介して実現 [* グリコーゲン分枝酵素欠乏症/Glycogen Branching Enzyme Deficiency(GBED)]
[出典] "Efficient correction of a deleterious point mutation in primary horse fibroblasts with CRISPR-Cas9" Pinzon-Arteaga C [..] Long CR. Sci Rep 2020-05-04

4. ショウジョウバエ変異ライブラリ構築 
[出典] "CRISPR/Cas9 mediated genetic resource for unknown kinase and phosphatase genes in Drosophila" Wu M, Zhang X, Wei W, Long L, An S, Gao G. Sci Rep 2020-04-30

5.  [レビュー] CRISPR/Cas9ゲノム編集による病害虫の殺虫剤に対する耐性機構解明 - ショウジョウバエ・モデルでの成果と限界、および、非モデル病害虫のゲノム編集の事例
[出典] REVIEW "Using CRISPR/Cas9 genome modification to understand the genetic basis of insecticide resistance: Drosophila and beyond" Douris V [..] Vontas J. Pestic Biochem Phys 2020-05-04

6. [ハイライト] Wessels HHらのNat. Biotechnol論文*
[出典] "Guiding Cas13 for RNA knockdown" Tang L. Nat Methods 2020-05-05(*) 2020-03-19 Cas13dによるRNAノックダウンに最適なcrRNAsを超並列スクリーン結果に基づく機械学習モデルにより設計

7. Enterococcus faecalis Cas1-Cas2インレグラーゼによるCRISPRスペーサの獲得過程を一分子FRET計測によりリアルタイムで観察・解析
[出典] "Real-time observation of CRISPR spacer acquisition by Cas1–Cas2 integrase" Budhathoki JB [..] Ke A. Nat Struct Mol Biol 2020-05-04

8. ATP結合アプタマーをCas12aのトランス切断活性 (コラテラル切断活性)の標的ssDNAと設計することで、ATPの高感度・高選択性検出を実現
[出典] "CRISPR-Cas12a based aptasensor for sensitive and selective ATP detection" Peng L [..] Man S, Ma L. Sensors and Actuators B: Chemical 2020-05-04

9. DETECTR様SARS-CoV-2迅速高感度検出キット: Wuhan-Hu-1株のorf1a, orf1b, NおよびE遺伝子を標的とするcrRNAを使用
[出典] "Rapid and Sensitive Detection of COVID-19 Using CRISPR/Cas12a-based Detection with Naked Eye Readout, CRISPR/Cas12a-NER" Wang X, Zhong M, Liu Y [..] Yang Z, Huang X, Liu M. Sci Bull (Beijing) 2020-05-05

10. CRISPR-Cas9編集効率が低いiPSCsを薬剤によるスクリーニングを介して効率的に回収
 解析対象とする遺伝子座と共に、CRISPR-Cas9 HDRを介して強心性配糖体に対する耐性を細胞にもたらすが細胞生存性に影響を及ぼさない変異をNa+/K+ポンプのサブユニットATP1A1に導入することで実現;実験の過程で、iPSCsのHDRには修復テンプレートとして長い (400 bp)dsDNAドナー・プラスミドが適していることも同定 (
Fig. 3 参照
[出典] "Enhanced genome editing in human iPSCs with CRISPR-CAS9 by co-targeting ATP1a1" Liu JT, Corbett JL, Heslop JA, Duncan SA. PeerJ 2020-05-01
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