crisp_bio

科学分野の比較的新しい論文と記事を記録しておくサイト: 主に、CRISPR生物学・技術開発・応用 (ゲノム編集, エピゲノム編集, 遺伝子治療, 分子診断/代謝工学, 合成生物学/進化, がん, 免疫, 老化, 育種 - 結果的に生物が関わる全分野) の観点から選択し、時折、タンパク質工学、情報資源・生物資源、新型コロナウイルスの起源・ワクチン・後遺症、機械学習・AIや研究公正からも選択

  • 同一論文・投稿 (to be publishedを含む)ごとのリストのため、新規公開エントリーより以前に公開されたエントリーも含まれている。
  • カラムTitleは、To be publishedの投稿については仮置であり、ジャーナルからの公開時には変更されている可能性がある。
  •  カラムRelease Dateの"AUTH"は"編集処理済、登録者の確認・同意待ち"を意味し、"HPUB"は"論文発表待ち"を意味する。
  • 2020年9月2日以前に公開された構造については、PDBj Web siteの新型コロナウイルスの構造情報 全エントリー, または, crisp_bioの過去記事「新型コロナウイルスのPDB公開構造一覧 - その6その5その4その3その2その1」参照
  • 2020-09-02日以後、PDBの更新に合わせて新規公開分を原則毎週水曜日に投稿

ID

Title

Release Date

論文

Tortorici, M.A.,Beltramello, M.,Lempp, F.A.,Pinto, D.,Dang, H.V.,Rosen, L.E.,McCallum, M.,Bowen, J.,Minola, A.,Jaconi, S.,Zatta, F.,De Marco, A.,Guarino, B.,Bianchi, S.,Lauron, E.J.,Tucker, H.,Zhou, J.,Peter, A.,Havenar-Daughton, C.,Wojcechowskyj, J.A.,Case, J.B.,Chen, R.E.,Kaiser, H.,Montiel-Ruiz, M.,Meury, M.,Czudnochowski, N.,Spreafico, R.,Dillen, J.,Ng, C.,Sprugasci, N.,Culap, K.,Benigni, F.,Abdelnabi, R.,Foo, S.C.,Schmid, M.A.,Cameroni, E.,Riva, A.,Gabrieli, A.,Galli, M.,Pizzuto, M.S.,Neyts, J.,Diamond, M.S.,Virgin, H.W.,Snell, G.,Corti, D.,Fink, K.,Veesler, D.

Ultrapotent human antibodies protect against SARS-CoV-2 challenge via multiple mechanisms.

Science 2020-09-24

7K3Q

An ultra-potent human neutralizing antibody locks the SARS-CoV-2 spike in the closed conformation

2020-10-07

7K43

SARS-CoV-2 spike in complex with the S2M11 neutralizing antibody Fab fragment

2020-10-07

7K45

SARS-CoV-2 spike in complex with the S2E12 neutralizing antibody Fab fragment (local refinement of the RBD and Fab variable domains)

2020-10-07

7K4N

SARS-CoV-2 spike in complex with the S2E12 neutralizing antibody Fab fragment

2020-10-07

投稿

Bracken, C.J.,Wells, J.A. (QCRG Structural Biology Consortium)

Bi-paratopic and multivalent human VH domains neutralize SARS-CoV-2 by targeting distinct epitopes within the ACE2 binding interface of Spike

To be publsihed

7JWB

SARS CoV2 Spike ectodomain with engineered trimerized VH binder

2020-10-07

投稿

Lee, J.,Worrall, L.J.,Vuckovic, M.,Rosell, F.I.,Gentile, F.,Ton, A.T.,Caveney, N.A.,Ban, F.,Cherkasov, A.,Paetzel, M.,Strynadka, N.C.J.

Crystallographic structure of wild-type SARS-CoV-2 Main Protease acyl-enzyme intermediate with physiological C-terminal autoprocessing site

To be published

7JP1

Structure of wild-type substrate free SARS-CoV-2 Mpro.

2020-10-07

投稿

Lee, J.,Worrall, L.J.,Vuckovic, M.,Rosell, F.I.,Gentile, F.,Ton, A.T.,Caveney, N.A.,Ban, F.,Cherkasov, A.,Paetzel, M.,Strynadka, N.C.J.

Crystallographic structure of wild-type SARS-CoV-2 Main Protease acyl-enzyme intermediate with physiological C-terminal autoprocessing site

To be published

7JOX

Acyl-enzyme intermediate structure of SARS-CoV-2 Mpro in complex with its C-terminal autoprocessing sequence.

2020-10-07

投稿

Wu, K.-P.,Chen, S.-K.,Lu, Y.-C.,Huang, Y.-C.J.,Lee, M.-H.

Crystal structure of SARS-CoV-2 Papain-like protease

To be published

7D47

Crystal structure of SARS-CoV-2 Papain-like protease C111S

2020-10-07

投稿

Lee, J.,Worrall, L.J.,Vuckovic, M.,Rosell, F.I.,Gentile, F.,Ton, A.T.,Caveney, N.A.,Ban, F.,Cherkasov, A.,Paetzel, M.,Strynadka, N.C.J.

Crystallographic structure of wild-type SARS-CoV-2 Main Protease acyl-enzyme intermediate with physiological C-terminal autoprocessing site

To be published

7JOY

Product structure of SARS-CoV-2 Mpro C145A mutant in complex with its C-terminal autoprocessing sequence.

2020-10-07

投稿

Qiao, J.X.,Zeng, R.,Li, Y.S.,Wang, Y.F.,Lei, J.,Yang, S.Y.

Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MI-23
タイトルが“Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with …”で始まりで, 文献はTo be publishedとされているエントリーが131件、Nat Struct Mol Biol, NatureならびにScience論文由来のエントリーが5件登録されている (2020-10-07時点)

To be published

7D3I

Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease in complex with MI-23

2020-10-07


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