[出典] "AcrHub: an integrative hub for investigating, predicting and mapping anti-CRISPR proteins" Wang J [..] Lithgow T. Nucleic Acids Res. 2020-11-02; [Webサイト] AcrHub.
2020-11-05 21.00.52
　Monash Universityと桂林電子科技大学の研究グループは今回、急速に発展してきたAcrタンパク質を対象とするデータベースを構築・公開した [機能の概観図をアブストラクトから右図に引用]
  • AcrHubは、実験検証された非冗長なAcrタンパク質を339種類と、原核生物と原核生物のウイルスのゲノム配列から推定した71,728種類のAcrタンパク質を格納している [格納データの統計がFigure 2のグラフにまとめられている]。
  • AcrHubは、予測ツールとして、自作のHMMをベースとした予測器、AcRanker [*1]およびPaCISPR [*2]の3種類を統合している。
  • 入力された配列から予測したAcrsと既知のAcrsとの関係を解析するに有用な類似性解析、系統解析および相同ネットワーク解析の3種類の解析モジュールを備えている。
 [参考crisp_bio記事]

 1. Acrデータベース
 2. Acr推定プログラム