[出典] "Structure of the miniature type V-F CRISPR-Cas effector enzyme" Takeda SN [..] Nishimasu H, Nureki O. Mol Cell. 2020-12-16. https://doi.org/10.1016/j.molcel.2020.11.035 (2020-12-17の時点ではDOI無効); https://www.cell.com/molecular-cell/fulltext/S1097-2765(20)30835-2
[構造情報] EMDB 30299/PDB 7C7L : Cryo-EM structure of the Cas12f1-sgRNA-target DNA complex (2020-12-17時点でHPUB)
- 西増・濡木グループは今回、タイプV-F CRISPR-Casエフェクター, Cas14aとしても知られているCas12f, とsgRNAおよび標的DNAの三者複合体の構造をクライオ電顕法により3.3 Åの分解能で再構成し、Cas9と異なりCas12fが非対称的二量体を形成していることを発見した。さらに、変異導入実験なども行なってCas12fが二本鎖DNA (dsDNA)を切断する分子機序を詳らかにした。
- Cas12f (529-aa)はSpCas9 (1368-aa)さらにはSaCas9 (1053 aa)よりもはるかに小型であり、ウイルスベクターによるデリバリの観点から今後の応用展開を期待できる。
本研究の日本語解説が東京大学・大学院理学系研究科・理学部のプレスリリースから公開されている：ゲノム編集のための最小のはさみ － CRISPR-Cas12fの立体構造を解明 － 武田 聖（生物科学専攻 修士課程1年); 西増 弘志 (先端科学技術研究センター 教授); 濡木 理（生物科学専攻 教授）https://www.s.u-tokyo.ac.jp/ja/press/2020/7160/
Cas12fとは [CRISPRメモ_2020/04/10 [第1項]を以下に引用)
クラス2 タイプV-Fに分類されている小型 (422–603 aa)のCRISPR-Cas12fファミリー10種類が5' T- またはCリッチなPAM配列を認識し、sgRNAに誘導されて標的dsDNAを切断し (Figure 1から引用した右図のCRISPR-Cas遺伝子座とエフェクタタンパク質の構成図を参照)、ファミリーの一部がE. coliを侵入dsDNAから保護することを同定した。また、標的ssDNA切断と同様に標的dsDNA切断が、ssDNAコラテラル切断活性を示すことも同定した。- [出典] "PAM recognition by miniature CRISPR–Cas12f nucleases triggers programmable double-stranded DNA target cleavage" Karvelis T, Bigelyte G, Young JK [..] Siksnys V (Vilnius University). Nucleic Acids Res 2020-04-04. https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkaa208
- crisp_bio 2018-10-19 メタゲノムからssDNAをトランス切断するCas14ファミリーを発見しDETECTRへ展開
- [出典] "Programmed DNA destruction by miniature CRISPR-Cas14 enzymes" Harrington LB, Burstein D [..] Doudna JA. Science 2018 Oct 18. https://dx.doi.org/10.1126/science.aav4294
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