[出典] "A Quantitative Proteome Map of the Human Body" Jiang L, Wang M [..] Snyder MP. [GTEx Consortium] Cell. 2020-09-10. https://doi.org/10.1016/j.cell.2020.08.036
ヒトの組織ごとにタンパク質のレベルを同定しRNAレベルと比較することで、タンパク質のレベルを調節するプロセスの理解だけでなくヒトの生物学と疾患の理解まで、深めることができる。
ヒトの組織ごとにタンパク質のレベルを同定しRNAレベルと比較することで、タンパク質のレベルを調節するプロセスの理解だけでなくヒトの生物学と疾患の理解まで、深めることができる。
GTEx Consortiumは今回、健常人の大脳皮質から頚骨動脈まで32種類の組織にわたる12,627遺伝子がコードするタンパク質を定量し、組織特異的に発現しているタンパク質または特定の組織にエンリッチされているタンパク質を同定し、トランスクリプトームデータと比較した [参考図 Graphical Abstract]。
- 組織特異的タンパク質をコードするユビキタスな転写物を多数発見した。
- RNAとタンパク質のエンリッチメントの不整合から、分泌タンパク質が合成され分泌される可能性があるサイトが見えてきた。
- 一連のタンパク質の組織特異的分布から、複数の組織間の相互作用を必要とする複雑な生物過程の詳細が見えてきた。
- 組織に依存するタンパク質の分布から、トランスクリプトームのデータだけからでは不可能であった
- 遺伝疾患のフェノタイプの説明が可能なことも明らかになった。
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