crisp_bio

科学分野の比較的新しい論文と記事を記録しておくサイト： 主に、CRISPR生物学・技術開発・応用 (ゲノム編集, エピゲノム編集, 遺伝子治療, 分子診断/代謝工学, 合成生物学/進化, がん, 免疫, 老化, 育種 - 結果的に生物が関わる全分野) の観点から選択し、時折、タンパク質工学、情報資源・生物資源、新型コロナウイルスの起源・ワクチン・後遺症、機械学習・AIや研究公正からも選択

｜CRISPR

[出典] "Novel CRISPR-based sequence specific enrichment methods for target loci and single base mutations" Steele JL [..] Shuber AP. PLoS One. 2020-12-23. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0243781

　2018年9月25日にCRISPR/Cas9をベースとする標的核酸濃縮法"Negative Enrichment"の米国特許*を獲得した Genetics Research LLCからの論文
2020-12-29 14.58.05
　標的遺伝子座の両端に増幅用プライマーに対する汎用アダプターをライゲーションするCAMP (CRISPR Associated Multiplexed PCR)とcCAMP (chimeric CRISPR Associated Multiplexed PCR) 、さらにアレル特異的プライマーを組み合わせることで特定の変異を帯びたアレルを持つ遺伝子座特異的な増幅を可能とするcTRACE (chimeric Targeting Rare Alleles with CRISPR-based Enrichment)、加えて、Cas9/sgRNAによって標的配列の末端を立体保護し、標的以外の配列を分解することで、標的配列を濃縮することで増幅反応を介することなく一塩基分解能で検出可能とするTRACE (Targeting Rare Alleles with CRISPR-based Enrichment)を報告した [Fig. S1引用右図参照]
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